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従来のプロテオーム解析はトランクリプトーム解析と比較すると分析深度が低く、3,000～5,000種類のタンパク質しか観測することができませんでした。これでは様々な分野で着目されることの多いキナーゼや転写因子などの微量タンパク質を観測するには不十分であり、さらなる分析深度の拡大が期待され続けてきました。本サービスの解析を担うかずさDNA研究所では次世代プロテオミクスと称されている分析深度、定量性に優れたDIAプロテオミクス技術を独自に最適化し、さらに最新鋭の質量分析計で測定することにより、哺乳類培養細胞から最大10,000種類のタンパク質を同定・比較定量を行えるシステムを構築しました（観測できるタンパク数はサンプルの種類に依存）。当受託ではこの最新鋭のシステムを用いた世界最高峰のプロテオーム解析を提供いたします。
● 使用機器
Orbitrap Exploris 480 （Thermo Fisher Scientific社）
Q-Exactive HF-X （Thermo Fisher Scientific社）
| サンプル種類 | 培養細胞、組織、タンパク質抽出物、血漿・血清、培養上清、ホルマリン固定パラフィン包埋組織など 本サービスはタンパク質配列が解析されている生物種が対象となります。 |
|---|---|
| 解析法 | 質量分析 |
| 報告内容 | MS測定データ (.rawファイル)、タンパク質同定・相対定量解析データ（解析ソフトウェア DIA-NN で出力されるデータ）、観測されたタンパク質名、タンパク質の定量値などを記載したリスト（Excel ファイル）をHDD、DVD-R またはUSB メモリスティックに収納して納品 |
| 目安納期 | 4週間～ |
| その他 | 作業内容: タンパク質抽出（サンプルが凍結培養細胞、凍結動物組織の場合）＋トリプシン消化＋リン酸化ペプチド濃縮＋質量分析 |
| メーカー希望小売価格(税別) | お問い合わせ下さい |
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