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製品の特長

オミックス解析を組み合わせて真の網羅的解析を

トランスクリプトーム解析、プロテオーム解析、メタボローム解析メニューからご希望のメニューを組み合わせて解析

トランスクリプトーム解析:

・真核生物 mRNA-Seq (TyepA:50bp Single-Read) 1,500万リード、750Mb

・真核生物 mRNA-Seq (TyepB:100bp Paired-End) 3,000万リード、3Gb

・miRNA-Seq (50bp Single-Read) 1,500万リード、750Mb

・3'RNA Seq 100万リード

プロテオーム解析:

・標準DIAプロテオーム解析によるタンパク質発現・相対定量解析:LC-MS/MS(DIA) 4000~6000タンパク質

・高深度DIAプロテオーム解析によるタンパク質発現・相対定量解析:GPF+LC-MS/MS(ライブラリ作製用)LC-MS/MS(DIA) 6000~8000タンパク質

・DIAリン酸化プロテオーム解析によるタンパク質発現・相対定量解析:LC-MS/MS (DDA, ライブラリ作製用) LC-MS/MS (DIA, 相対定量解析用) 4000〜8000リン酸化ペプチド断片

・高深度DIAリン酸化プロテオーム解析による比較定量解析:GPF+LC-MS/MS (DDA, ライブラリ作製用) LC-MS/MS(DIA, 相対定量解析用) 8000〜15000リン酸化ペプチド断片

メタボローム解析:

・脂溶性代謝物解析:網羅的代謝物の同定・相対定量解析

高深度なノンバイアス(ノンターゲット)スクリーニングによる高網羅的な脂質代謝物の同定・相対定量解析

・脂溶性代謝物解析:標的代謝物の相対定量解析

フォーカシング(ターゲット)解析:遊離脂肪酸の相対定量解析

・水溶性代謝物解析:標的代謝物の相対定量解析

”ワイド”フォーカシング解析:包括的な親水性代謝物の相対定量解析

本サービスはプロメガ社・かずさテクノロジーズ社の共同サービスとなります。

概要

ひとつのサンプルからRNAとタンパク質を抽出し、トランスクリプトーム解析及びプロテオーム解析を同時に実施します。プロテオーム解析の分析深度が従来よりも圧倒的に高まったことで観測対象となる分子が大幅に増加し、トランスクリプトーム解析データとの遺伝子数の差が小さくなりました。より包括的なデータが得られ、従来の技術では見いだせなかった新しい発見が期待できます。

サンプル(細胞、組織の場合)はフェノールグアニジン系の試薬、もしくはRNA保護試薬に浸した状態で送付するだけで良く、RNA・タンパク質抽出から解析までかずさDNA研究所にて一貫して行います。

●使用機器

トランスクリプトーム解析:NextSeq 2000, NextSeq 500, MiSeq[イルミナ社], PacBio Sequel, PacBio Sequel II [PacBio社]

プロテオーム解析:Orbitrap Exploris 480 [Thermo Fisher Scientific社]

Q-Exactive HF-X [Thermo Fisher Scientific社]

● プロテオーム解析はタンパク質配列が解析されている生物種が対象となります。

仕様

サンプル種類total RNA:2 μg以上(40 ng/μL以上) タンパク質:40 ug以上 目安:細胞 5×10^5 以上, 組織 10 mg以上, 血清/血漿 1 uL以上, 尿 200 uL以上
解析法次世代シーケンサー、質量分析
報告内容作業報告書、fastqファイル、MSデータ、Scaffold DIA、最終的な解析結果* を記載したファイルの入ったDVD またはUSB メモリスティック *①プロテオームの最終的な解析結果、②簡易データ解析によるRNA の発現量リスト、③プロテオームと3'RNA-Seq の発現量対応リストを含みます(②と③はヒト、マウス検体のみ)
目安納期ご希望の解析メニューのうち最も納期が長いもの+1週間程度
その他■選択した解析メニューにより価格が異なります。お気軽にお見積りをご請求ください。:
メーカー希望小売価格(税別)お問い合わせ下さい
表示価格は代表的な仕様のものです。詳細はお問い合わせください。
メーカーかずさゲノムテクノロジーズ
販売元
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