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トランスクリプトームシーケンシングでは、RNA 解析によりサンプル間の 発現量の差 (Expression profile) を見ることができ、リファレンスデー タベースがない種でも GS-FLX / HiSeq など、様々なプラットフォーム を用いた新規トランスクリプトーム解析を行えます。
21~23個のヌクレオチドで構成されている非翻訳領域の small RNA (small non-coding RNA) が siRNA や miRNA として作用するメカニ ズムはよく知られています。
サンプル種類 | ヒト、マウス、ラットなど |
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解析法 | 次世代シーケンサーNovaseq 6000、HiSeq2500 |
報告内容 | シーケンシング結果(fastq) サンプル間の発現レベル比較結果 |
目安納期 | ●mRNA-seq(Novaseq 6000) シーケンス : 4~6 週間 ●small RNA-seq(HiSeq2500) 約 8 週間(データ解析まで) |
その他 | ●mRNA-seq(Novaseq 6000): ライブラリ作製およびシーケンス : TruSeq® Stranded mRNA Library Prep 使用の場合: 40,000 円/サンプル: TruSeq® stranded Total RNA Library Prep. Kit with RiboZero Plus kitの場合: 51,000円/サンプル: データ解析: 16,000 円/サンプル (Human,MouseサンプルのDEG解析): ●small RNA-seq(HiSeq2500): ライブラリー作製 : 51,000 円 1 レーン : 21.5 万円 データ解析 : 49,000 円 |
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