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LC/MS/MS は高速液体クロマトグラフ (HPLC) と質量分析計 (MS) を結合させた装置です。まず、サンプルを LC 部で親和性の差によって成分ごとに分離し、試料成分を 1 段目の MS でイオン化(ESI法)し、質量ごとにわけて(プレカーサイオン)、さらに分離されたイオンを衝突室 (コリジョンセル) 内でアルゴンガスに衝突させてイオンを解離させます (プロダクトイオン)。そのイオンを 2 段目の MS で検出する手法です。
本サービスではタンパク質を Trypsin で分解し、そのペプチド溶液を LC/MS/MS に供します。得られた MS/MS データを用いて Mascot 検索を行い、その結果をご報告いたします。ゲノムデータベースが公開されていない種由来のタンパク質を LC-MS/MS で解析する場合は、ゲノムが類似している生物種のデータベースからアミノ酸配列が類似しているタンパク質として同定できる可能性がございます。
サンプル種類 | CBB染色もしくは銀染色によって染色したゲルから切り出したバンド (もしくはスポット) |
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解析法 | Chromatography: Waters nanoUPLC Mass Spectrometry: Finnigan LCQ iontrap (Thermo scientific) Positive ion mode, scan range (m/z) = 400 – 2000 Da Column: ACQUITYUPLC BEH C18 1.7 um, 100 um x 100 mm Solvent: DW : Acetonitrile (0.1% Formic acid) Flow rate: 0.4 ul/min Search program: Mascot search engine (Matrix Science Limited, UK) |
報告内容 | データは FTP サーバーにアップされますので、そこからダウンロードして頂きます。 Mascot searchによるタンパク質同定結果 1 種類 (Mascot searchの生データ;htmlファイル) タンパク質同定結果の一覧 (エクセルファイル) 解析方法、結果の見方を記載した報告書 (PDF ファイル) |
目安納期 | 15営業日 |
その他 | ボリュームディスカウント実施中!! : 10~19検体 : 10%OFF 20~29検体 : 20%OFF 30検体以上 : 30%OFF |
メーカー希望小売価格(税別) | 76,000円 |
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