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RNA-seq解析サービス
P2KRB1000004-1
製品の特長 - RNA-seq解析サービス
サービス特長
既知の遺伝子発現解析だけでなく、マイクロアレイでは解析できない新規転写産物の検出やスプライシングバリアントの検出、融合遺伝子の検出が可能です
またシーケンス量を大きくすることで、低発現の転写産物の検出が可能になります
弊社独自の解析ソフト、TranscriptomeViewerも使用可能です(条件有)
サービス説明 - RNA-seq解析サービス
Total RNAからpolyA RNAを精製、逆転写反応で合成したcDNAをシーケンシングします。
ヒト・マウス・ラットなど哺乳動物を対象にした遺伝子発現解析の場合、シーケンス方法は100bpペアエンドシーケンス、取得リード数は40million readでの解析を推奨しています。
データ解析においては、既知のゲノム配列にマッピングし、遺伝子領域内にマッピングされたリード数をカウントし、遺伝子領域長で補正されたデータ（FPKM値）を遺伝子発現値として算出します。
【遺伝子発現解析】：各遺伝子、転写産物の発現値（FPKM値、オプション）を報告します。解析データは弊社開発の「Transcriptome viewer」にてご覧いただくことができます。Transcriptome Viewerでは統計解析によるサンプル間の遺伝子発現比較、発現変動遺伝子の抽出（フィルタリング）、データのグラフ化・可視化（散布図、クラスタリング）などが利用可能で、シーケンス解析後の2次解析をスムーズに進めることができます。
・その他、新規転写産物やスプライシングバリアントの検出も可能です(オプション)
仕様 - RNA-seq解析サービス
| サンプル種類 | Total RNA 3.0μg以上（濃度100ng/μl以上） RIN 7以上、rRNAピーク比 1以上 |
|---|---|
| 解析法 | 該当項目: なし |
| 報告内容 | 【標準サービス納品物】 ・サンプル初期チェックレポート ・シーケンシングサマリー ・配列データ（FASTQ形式） |
| 目安納期 | QCクリア後6-8週間 |
| その他 | ※サンプル種、検体数により価格前後いたします。詳しくはお問い合わせください: ※記載の価格はヒト検体、40Mリード、fastqファイル納品、30検体以上の場合の単価です: |
| メーカー希望小売価格(税別) | 40,000円〜 |
表示価格は代表的な仕様のものです。詳細はお問い合わせください。
注意事項
- 価格及び、サービスの仕様・内容などにつきまして、予告なしに変更されることがあります。
- 表示している参考価格に消費税等は含まれておりません。