製品の特長 - Exome-seq解析サービス サービス特長
キャプチャープローブを用いてゲノムDNAからコーディング領域のDNAを濃縮、シーケンシングすることで特定領域に絞った変異解析を実施します
エクソン領域の遺伝子変異はアミノ酸置換を伴う変異に影響を与える可能性があり、全ゲノムを対象にしたシーケンス解析よりも低コスト、効率的、信頼性の高い(高カバレッジ)のデータを取得することができます
キャプチャープローブは実績多数のアジレント社SureSelectターゲットエンリッチメントシステムを利用します
サービス説明 - Exome-seq解析サービス
ゲノムDNAにエクソン領域配列と相同性のあるキャプチャープローブをハイブリダーゼーションさせ、解析対象領域となるDNA配列を回収し、シーケンス解析へ進めます。ヒトの場合、利用するキャプチャープローブによって推奨するシーケンス量が異なります。データ解析においては、既知のゲノム配列(リファレンス配列)にマッピングし、それぞれの染色体位置において変異が起こっている確率を算出します。
仕様 - Exome-seq解析サービス サンプル種類 ゲノムDNA 3.0μg以上(濃度50ng/μl以上) 解析法 該当項目: なし 報告内容 【標準サービス納品物】
・サンプル初期チェックレポート
・シーケンシングサマリー
・配列データ(FASTQ形式) 目安納期 QCクリア後8週間 その他 ※サンプル種、検体数により価格前後いたします。詳しくはお問い合わせください : ※記載の価格はヒト検体、7G、fastqファイル納品、30検体以上の場合の単価です : メーカー希望小売価格(税別) 43,000円〜
表示価格は代表的な仕様のものです。詳細はお問い合わせください。
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Previous 各染色体部位において検出した遺伝子変異情報(SNP, short InDel)をエクセルファイルにて報告します。変異情報としては①変異を検出した染色体部位(染色体番号、塩基番号)②変異情報(標準/変異塩基配列情報、シーケンス頻度)③変異箇所の遺伝子情報(遺伝子名、各種データベースID、変異頻度など)となります。
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