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製品の特長 - シングルセルRNA-seq 解析
特長
細胞の分化過程の解明
細胞の多様性の解明
疾患サンプルに特有な細胞群の検出などの研究に役立ちます
概要 - シングルセルRNA-seq 解析
シングルセルRNAseqとは、細胞の遺伝子発現プロファイルを一細胞レベルで取得して観測する画期的な技術です。これまでのRNAseq解析では、観測対象が細胞集団であり、細胞集団における各遺伝子の”平均的な”遺伝子発現を測定していました。一方、scRNAseqは細胞集団内の個々のトランスクリプトームを捉え、細胞特異的な変化を同定することが可能になります。
仕様 - シングルセルRNA-seq 解析
| サンプル種類 | サンプルタイプ：細胞 ※一般的な生物種およびモデル生物に対応 |
|---|---|
| 解析法 | 【シングルセルRNAシーケンス】 ・10x Genomics社 Chromiumによるライブラリ調製 ・Illumina社 NovaSeq6000による120Gbのシーケンシング ・Cell Rangerによる発現定量 【バイオインフォマティクス解析】 ・発現定量解析（クオリティコントロール、正規化、データ統合、次元削減、クラスタリングおよびUMAP上の可視化、クラスタごとの特徴遺伝子の探索、着目遺伝子の発現量可視化（Feature plot, Violin plot）） ・サンプル間比較解析（各クラスタにおけるサンプル間発現比較解析、GO（Gene Ontology）解析、Reactomeパスウェイ解析） ・擬似系譜解析（Cell trajectoryの推定、Pseudotime の推定、着目遺伝子の発現パターン可視化） |
| 報告内容 | ・報告書 ・Cell Ranger解析結果一式 ・Loupe Browser用閲覧ファイル ・クラスタリング結果のPCA/t-SNEプロット（PDF） ・各クラスタの発現マトリクスファイル（CSV） ・Feature plot（PDF） ・発現変動遺伝子リストファイル（XLSX） |
| 目安納期 | お問い合わせ |
| その他 | サンプルタイプ: 細胞 注意事項1: 凍結状態であること。 注意事項2: 細胞数は10^6細胞以上であること。 注意事項3: 融解後の細胞の生存率が90%以上推奨。 注意事項4: 細胞は分散もしくは単離してください。 注意事項5: EDTA0.1mM以下、マグネシウム3mM以下、界面活性剤は含まないこと。 注意事項6: 細胞サイズが直径30μm以下であること。 注意事項7: 40μmのフィルターにかけてください。 注意事項8: 凍結の際にはセルバンカー等を用いてください。 |
| メーカー希望小売価格(税別) | お問い合わせ下さい |
表示価格は代表的な仕様のものです。詳細はお問い合わせください。
注意事項
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