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製品の特長 - circRNA-seq解析

特長

サンプルで発現しているcircRNAの網羅的な検出と発現定量

神経系疾患の研究で用いられることが多い

概要 - circRNA-seq解析

環状RNAの検出から定量・アノテーションまでこれひとつ

back splicingにより生じる環状RNA(circRNA)の検出、発現量定量、既知circRNAデータベースとの比較を行います。ご要望があれば、サンプル間の発現変動比較、クラスタリングなども実施可能です。初めに、rRNA除去またはpoly(A)除去したRNA-seqデータをお預かりし、解析後、結果をウェブミーティング等でご報告します。

仕様 - circRNA-seq解析

サンプル種類一般的な生物種およびモデル生物に対応
解析法・クオリティコントロール  シーケンスデータのクオリティコントロール ・circRNA-seq解析  参照ゲノムへのマッピング  circRNA検出および発現定量  circBaseを用いた既知circRNAアノテーション ・検出されたcircRNAの発現量の二群間比較(オプション)
報告内容・データ解析結果報告書(PDF) ・クオリティーコントロール後データ(FASTQ) ・マッピング結果(BAM/SAM) ・circRNA発現量一覧表(TXT) ・(オプション)circRNA発現量の二群間比較(TXT)
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その他供与物 : シーケンスデータ(FASTQ)
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表示価格は代表的な仕様のものです。詳細はお問い合わせください。
メーカーアメリエフ
販売元アメリエフ
メーカーサイト製品ページ
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J017-1_circRNA発現量一覧表(TXT)

J017-1_circRNA発現量一覧表(TXT)

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