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製品の特長 - RNA-seq 解析
特長
サンプルで発現しているcircRNAの網羅的な検出と発現定量
神経系疾患の研究で用いられることが多い
キャンペーン中！
2024年03月31日から2024年07月16日までRNA-seq解析【新年度受託解析キャンペーン】
詳細を見る概要 - RNA-seq 解析
RNAseq解析とは、次世代シーケンサー（NGS）を用いて転写物の塩基配列を決定する方法です。この配列をリファレンスゲノムへアライメントし、転写産物毎の発現量を測定し、通常はサンプル間の発現量の比較解析を行います。スプライスバリアント毎の発現解析、融合遺伝子検出、変異解析、新たな転写産物の予測を行うことができます。
仕様 - RNA-seq 解析
| サンプル種類 | サンプルタイプ：total RNA ※一般的な生物種およびモデル生物に対応 |
|---|---|
| 解析法 | 【RNAシーケンス】 ・ライブラリ調製 ・Illumina社 NovaSeq6000による（PolyA 4Gb/13.3Mペアエンドリード、non stranded RNA-seq）シーケンシング ※４Gbを超える場合や、strand specific RNA-seqをご希望の場合はお問合せください 【バイオインフォマティクス解析】 ・発現定量解析：マッピング、 発現定量、階層的クラスタリング (ヒートマップ描画)、 主成分分析 ・二群間の発現量比較解析：Volcano plot ※サンプル数によって対応可能な組み合わせ数が異なります。統計的な解析には 各群3サンプル以上必要です。 ・エンリッチメント解析：Gene Ontology解析、パスウェイ解析 (Reactome) |
| 報告内容 | ・データ解析結果報告書(PDF) ・発現変動解析結果ファイル（XLSX） ・Volcano plot（PDF） ・ヒートマップ（PDF） |
| 目安納期 | お問い合わせ |
| その他 | サンプルタイプ: total RNA : 総量（ng）: 200以上 液量（µL）: 10以上 濃度（ng/μL）: 20以上 RIN値: 4.0以上 with flat base line 純度: OD260/280 = 1.8-2.2, OD260/230 ≥ 1.8, no degradation, no contamination |
| メーカー希望小売価格(税別) | お問い合わせ下さい |
表示価格は代表的な仕様のものです。詳細はお問い合わせください。
注意事項
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