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製品の特長 - RNA-seq 解析

特長

サンプルで発現しているcircRNAの網羅的な検出と発現定量

神経系疾患の研究で用いられることが多い

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概要 - RNA-seq 解析

RNAseq解析とは、次世代シーケンサー(NGS)を用いて転写物の塩基配列を決定する方法です。この配列をリファレンスゲノムへアライメントし、転写産物毎の発現量を測定し、通常はサンプル間の発現量の比較解析を行います。スプライスバリアント毎の発現解析、融合遺伝子検出、変異解析、新たな転写産物の予測を行うことができます。

仕様 - RNA-seq 解析

サンプル種類サンプルタイプ:total RNA ※一般的な生物種およびモデル生物に対応
解析法【RNAシーケンス】 ・ライブラリ調製 ・Illumina社 NovaSeq6000による(PolyA 4Gb/13.3Mペアエンドリード、non stranded RNA-seq)シーケンシング ※4Gbを超える場合や、strand specific RNA-seqをご希望の場合はお問合せください 【バイオインフォマティクス解析】 ・発現定量解析:マッピング、 発現定量、階層的クラスタリング (ヒートマップ描画)、 主成分分析 ・二群間の発現量比較解析:Volcano plot ※サンプル数によって対応可能な組み合わせ数が異なります。統計的な解析には 各群3サンプル以上必要です。 ・エンリッチメント解析:Gene Ontology解析、パスウェイ解析 (Reactome)
報告内容・データ解析結果報告書(PDF) ・発現変動解析結果ファイル(XLSX) ・Volcano plot(PDF) ・ヒートマップ(PDF)
目安納期お問い合わせ
その他サンプルタイプ: total RNA
:
総量(ng): 200以上
液量(µL): 10以上
濃度(ng/μL): 20以上
RIN値: 4.0以上 with flat base line
純度: OD260/280 = 1.8-2.2, OD260/230 ≥ 1.8, no degradation, no contamination
メーカー希望小売価格(税別)お問い合わせ下さい
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メーカーアメリエフ
販売元アメリエフ
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データ解析内容

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