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生物ゲノムの多様性に迫る。多様な変異の種類もワンストップで。
変異検出(Resequencing)、遺伝子情報のアノテーションを行います。ヒトサンプルの場合は、各種SNPデータベースの情報も追加します。変異の種類はSNVとshort indel のほか、構造変異(SV)やコピー数多系(CNV)もお任せください。
サンプル種類 | 一般的な生物種だけでなく、動物、植物、微生物、ウイルスにも対応が可能です。お問い合わせください。 |
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解析法 | ・シーケンスデータクオリティコントロール 使用ソフトウェア:FastQC、オリジナルスクリプト ・変異検出 参照ゲノムへのマッピング 使用ソフトウェア:BWA 変異(SNV/Indel)検出 使用ソフトウェア:GATK haplotypecaller ・アノテーション 遺伝子情報アノテーション、既知SNPデータベースのアノテーション *変異の種類(構造変異やコピー数多系)により異なります |
報告内容 | ・報告書 ・クオリティーコントロール後データ(FASTQ) ・マッピング結果ファイル(BAM) ・アノテーション済み変異ファイル(VCF) |
目安納期 | お問い合わせ |
その他 | 供与物1: シーケンスデータ(FASTQ) *illuminaシーケンサデータ 供与物2: サンプル情報(サンプル名、ケース・コントロール情報、生物種など) |
メーカー希望小売価格(税別) | お問い合わせ下さい |
注意事項