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製品の特長

特長

整理されたエッセンス

豊富な実習

高いカスタマイズ性

打つべきコマンドだけでなく、処理の意味や結果の解釈まで含めた解説

概要

低コストな遺伝子-フェノタイプのスクリーニング解析といえばコレ

case, controlのSNPアレイデータを用いたGWAS解析について、豊富なデータ解析経験を持つエンジニアが講義致します。客観的な評価に基づいたオープンソースソフトウェアを用います。公開シーケンスデータを用いた実践的な実習で、初心者から経験者まで効率的にスキルを身に着けていただけます。

仕様

サンプル種類該当項目: なし
解析法該当項目: なし
報告内容講義スライドのハンドアウト
目安納期該当項目: なし
その他受講に必要なもの: ノートPC、プロジェクタ、外部サーバへssh接続可能な環境 ※ 接続不可の場合はご相談ください
内容: SNPアレイデータ(PED, MAP)の読み込み、クオリティコントロール、遺伝的集団構造の検出(PCA)、SNPと形質の関連性の計算(case-control association analysis)、マンハッタンプロットとQ-Qプロットの作図、SNPへのアノテーション、SNPの近傍遺伝子や連鎖状態の可視化、SNPと量的形質の関連性の計算、共変量を考慮したQTL analysis、サンプルの集団構造を考慮したcase-control association analysis ※ご要望に合わせ追加・変更が可能です  ※ご要望に合わせ追加・変更が可能です
時間: 3時間
実施形態: オンライン、または、ご訪問しスライドを用いて説明します。お客様のノートPCから、解析環境構築済みの弊社webサーバへ接続・実習を行っていただきます。
メーカー希望小売価格(税別)180,000円〜
表示価格は代表的な仕様のものです。詳細はお問い合わせください。
メーカーアメリエフ
販売元アメリエフ
メーカーサイト製品ページ
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科目一覧

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注意事項

  • 価格及び、サービスの仕様・内容などにつきまして、予告なしに変更されることがあります。
  • 表示している参考価格に消費税等は含まれておりません。