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SNPアレイデータを用いたGWAS解析について、豊富なデータ解析経験を持つエンジニアが講義致します。客観的な評価に基づいたオープンソースソフトウェアを用います。公開シーケンスデータを用いた実践的な実習で、初心者から経験者まで効率的にスキルを身に着けていただけます。
サンプル種類 | 該当項目: なし |
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解析法 | 該当項目: なし |
報告内容 | 講義スライドのハンドアウト |
目安納期 | 該当項目: なし |
その他 | 受講に必要なもの: ノートPC、プロジェクタ、外部サーバへssh接続可能な環境 ※ 接続不可の場合はご相談ください 内容: SNPアレイデータ(PED, MAP)の読み込み、クオリティコントロール、遺伝的集団構造の検出(PCA)、SNPと形質の関連性の計算(case-control association analysis)、マンハッタンプロットとQ-Qプロットの作図、SNPへのアノテーション、SNPの近傍遺伝子や連鎖状態の可視化、SNPと量的形質の関連性の計算、共変量を考慮したQTL analysis、サンプルの集団構造を考慮したcase-control association analysis ※ご要望に合わせ追加・変更が可能です ※ご要望に合わせ追加・変更が可能です 時間: 3時間 実施形態: オンライン、または、ご訪問しスライドを用いて説明します。お客様のノートPCから、解析環境構築済みの弊社webサーバへ接続・実習を行っていただきます。 |
メーカー希望小売価格(税別) | 180,000円〜 |
注意事項