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製品の特長 - バイオインフォマティクス・トレーニング シングルセルRNA解析【Seurat】

特長

整理されたエッセンス

豊富な実習

高いカスタマイズ性

打つべきコマンドだけでなく、処理の意味や結果の解釈まで含めた解説

概要 - バイオインフォマティクス・トレーニング シングルセルRNA解析【Seurat】

single cell RNA-seq解析の最も基幹部分をマスター

クラスタリングや、マーカー遺伝子によるcell type同定を中心に、豊富なデータ解析経験を持つエンジニアが講義致します。客観的な評価に基づいたオープンソースソフトウェアを用います。公開シーケンスデータを用いた実践的な実習で、初心者から経験者まで効率的にスキルを身に着けていただけます。

仕様 - バイオインフォマティクス・トレーニング シングルセルRNA解析【Seurat】

サンプル種類該当項目: なし
解析法該当項目: なし
報告内容講義スライドのハンドアウト
目安納期該当項目: なし
その他受講に必要なもの: ノートPC、プロジェクタ、外部サーバへssh接続可能な環境 ※ 接続不可の場合はご相談ください
内容: クオリティコントロール、細胞間のライブラリサイズによる発現量の違いの正規化、遺伝子のフィルタリング、データのスケーリングとノイズの除外、次元削減(PCA, tSNE)、下流解析で使用する主成分軸数の決定、クラスタリング、マーカー遺伝子探索とセルタイプ同定、疑似系譜解析(・pseudo-timeの構築と細胞のstateの分類 ・pseudo-time内での遺伝子の発現変動の可視化) ※ご要望に合わせ追加・変更が可能です
時間: 3時間
実施形態: オンライン、または、ご訪問しスライドを用いて説明します。お客様のノートPCから、解析環境構築済みの弊社webサーバへ接続・実習を行っていただきます。
メーカー希望小売価格(税別)180,000円〜
表示価格は代表的な仕様のものです。詳細はお問い合わせください。
メーカーアメリエフ
販売元アメリエフ
メーカーサイト製品ページ
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科目一覧

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注意事項

  • 価格及び、サービスの仕様・内容などにつきまして、予告なしに変更されることがあります。
  • 表示している参考価格に消費税等は含まれておりません。