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single cell RNA-seq解析の最も基幹部分をマスター
クラスタリングや、マーカー遺伝子によるcell type同定を中心に、豊富なデータ解析経験を持つエンジニアが講義致します。客観的な評価に基づいたオープンソースソフトウェアを用います。公開シーケンスデータを用いた実践的な実習で、初心者から経験者まで効率的にスキルを身に着けていただけます。
サンプル種類 | 該当項目: なし |
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解析法 | 該当項目: なし |
報告内容 | 講義スライドのハンドアウト |
目安納期 | 該当項目: なし |
その他 | 受講に必要なもの: ノートPC、プロジェクタ、外部サーバへssh接続可能な環境 ※ 接続不可の場合はご相談ください 内容: クオリティコントロール、細胞間のライブラリサイズによる発現量の違いの正規化、遺伝子のフィルタリング、データのスケーリングとノイズの除外、次元削減(PCA, tSNE)、下流解析で使用する主成分軸数の決定、クラスタリング、マーカー遺伝子探索とセルタイプ同定、疑似系譜解析(・pseudo-timeの構築と細胞のstateの分類 ・pseudo-time内での遺伝子の発現変動の可視化) ※ご要望に合わせ追加・変更が可能です 時間: 3時間 実施形態: オンライン、または、ご訪問しスライドを用いて説明します。お客様のノートPCから、解析環境構築済みの弊社webサーバへ接続・実習を行っていただきます。 |
メーカー希望小売価格(税別) | 180,000円〜 |
注意事項