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製品の特長 - GWAS（ゲノムワイド関連解析）
特長
様々な形質に関連する遺伝子の探索
疾患や健康情報の研究に役立ちます
育種研究に役立ちます
概要 - GWAS（ゲノムワイド関連解析）
GWASは現代の純遺伝学。ビックデータ時代のいまこそ始めましょう！
ゲノム全体をほぼカバーする一塩基多型（SNP）の遺伝子型データを用いて、SNPと形質との関係を統計的に調べる方法です。形質は0・1で表されるケース・コントロール形質、量的形質のどちらも解析することができます。
GWASと関連して、SNP間の遺伝子型を推定する手法である、インピュテーションの実施もご相談ください。
仕様 - GWAS（ゲノムワイド関連解析）
| サンプル種類 | 一般的な生物種およびモデル生物に対応 |
|---|---|
| 解析法 | ・データのクオリティコントロール 低クオリティSNPまたはサンプルの除外 主成分分析（PCA） 近親サンプルの除外 コホートとは異なるバックグラウンドをもつサンプルの除外 ・GWAS 共変量による補正 関連解析 使用ソフトウェア：PLINK、qqman、LocusZoom ・有意なSNPのアノテーション 使用ソフトウェア：PLINK、LocusZoom ・Polygenic Risk Score解析 （オプション） 使用ソフトウェア：PRSice2 |
| 報告内容 | ・データ解析結果報告書 ・PCA結果（PDF） ・マンハッタンプロット（全ゲノム、および有意なSNP周辺の拡大画像）（PDF） ・QQプロット（PDF） ・SNPアノテーション結果ファイル（TXT） |
| 目安納期 | お問い合わせ |
| その他 | 供与物１: SNPアレイデータ（ped、map、FinalReport） 供与物２: SNPアレイ情報（製品名） 供与物３: サンプル情報（サンプル名、形質） 供与物４: 共変量情報（ご相談ください） |
| メーカー希望小売価格(税別) | お問い合わせ下さい |
表示価格は代表的な仕様のものです。詳細はお問い合わせください。
注意事項
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