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製品の特長

特長

様々な形質に関連する遺伝子の探索

疾患や健康情報の研究に役立ちます

育種研究に役立ちます

概要

GWASは現代の純遺伝学。ビックデータ時代のいまこそ始めましょう!

ゲノム全体をほぼカバーする一塩基多型(SNP)の遺伝子型データを用いて、SNPと形質との関係を統計的に調べる方法です。形質は0・1で表されるケース・コントロール形質、量的形質のどちらも解析することができます。

GWASと関連して、SNP間の遺伝子型を推定する手法である、インピュテーションの実施もご相談ください。

仕様

サンプル種類一般的な生物種およびモデル生物に対応
解析法・データのクオリティコントロール  低クオリティSNPまたはサンプルの除外  主成分分析(PCA)  近親サンプルの除外  コホートとは異なるバックグラウンドをもつサンプルの除外 ・GWAS  共変量による補正  関連解析   使用ソフトウェア:PLINK、qqman、LocusZoom ・有意なSNPのアノテーション  使用ソフトウェア:PLINK、LocusZoom ・Polygenic Risk Score解析 (オプション)  使用ソフトウェア:PRSice2
報告内容・データ解析結果報告書 ・PCA結果(PDF) ・マンハッタンプロット(全ゲノム、および有意なSNP周辺の拡大画像)(PDF) ・QQプロット(PDF) ・SNPアノテーション結果ファイル(TXT)
目安納期お問い合わせ
その他供与物1:  SNPアレイデータ(ped、map、FinalReport)
供与物2: SNPアレイ情報(製品名)
供与物3: サンプル情報(サンプル名、形質)
供与物4: 共変量情報(ご相談ください)
メーカー希望小売価格(税別)お問い合わせ下さい
表示価格は代表的な仕様のものです。詳細はお問い合わせください。
メーカーアメリエフ
販売元アメリエフ
メーカーサイト製品ページ
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マンハッタンプロット(全ゲノム)

マンハッタンプロット(全ゲノム)

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