製品の特長 - オプティカルゲノムマッピング受託解析サービス
米国Bionano Genomics社のSaphyr® Systemによるオプティカルゲノムマッピング解析を行います。
分裂期であることに依存せず、標本の作製も不要のため、固形腫瘍など染色体が得にくい検体の解析にも有効です。
従来の技術では困難であった1 Mbレベルの長鎖DNAフラグメントの解析を実現しており、ゲノム中に存在する挿入・欠失・転座・逆位・重複といった⼤きな構造変化やrare variantの検出が可能です。
さらに次世代シーケンサー(NGS)データと組み合わせるHybrid Scaffoldingによるゲノムアッセンブリに対応し、NGSデータのアッセンブリを染色体レベルまで改善した例もあります。
解析内容 - オプティカルゲノムマッピング受託解析サービス
ゲノムDNAの抽出はbionano社のキットを使用
DLE-1を用いて標識を実施
3検体を同時に解析致します
オプティカルゲノムマッピング概要
- オプティカルゲノムマッピング受託解析サービス
仕様 - オプティカルゲノムマッピング受託解析サービス
サンプル種類 | ヒト由来培養細胞株 |
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解析法 | オプティカルゲノムマッピング解析 |
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報告内容 | bnx (Molecules)ファイル、cmap(De Novo Assembly)データ |
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目安納期 | 検体受領後1ヶ月 |
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その他 | 解析場所: アズワン殿町ラボ
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メーカー希望小売価格(税別) | 800,000円 |
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構造バリアントは、Circos Plot上で確認ができます。