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製品の特長

米国Bionano Genomics社のSaphyr® Systemによるオプティカルゲノムマッピング解析を行います。

分裂期であることに依存せず、標本の作製も不要のため、固形腫瘍など染色体が得にくい検体の解析にも有効です。

従来の技術では困難であった1 Mbレベルの長鎖DNAフラグメントの解析を実現しており、ゲノム中に存在する挿入・欠失・転座・逆位・重複といった⼤きな構造変化やrare variantの検出が可能です。

さらに次世代シーケンサー(NGS)データと組み合わせるHybrid Scaffoldingによるゲノムアッセンブリに対応し、NGSデータのアッセンブリを染色体レベルまで改善した例もあります。

解析内容

ゲノムDNAの抽出はbionano社のキットを使用

DLE-1を用いて標識を実施

3検体を同時に解析致します

オプティカルゲノムマッピング概要

仕様

サンプル種類ヒト由来培養細胞株
解析法オプティカルゲノムマッピング解析
報告内容bnx (Molecules)ファイル、cmap(De Novo Assembly)データ
目安納期検体受領後1ヶ月
その他解析場所: アズワン殿町ラボ
メーカー希望小売価格(税別)800,000円
表示価格は代表的な仕様のものです。詳細はお問い合わせください。
メーカーアズワン
販売元アズワン
メーカーサイト製品ページBionano社のホームページ
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構造バリアントは、Circos Plot上で確認ができます。

構造バリアントは、Circos Plot上で確認ができます。

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