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16S/18S/ITS アンプリコンシーケンス解析
P2BGJ1000020-1
製品の特長 - 16S/18S/ITS アンプリコンシーケンス解析
サービス仕様
BGIの16S/18S/ITS アンプリコンシーケンス解析サービスは、DNBSEQシーケンシングシステムで実行されます。
PCRは異なる16S/18S/ITS領域を分離するために使用
DNBSEQによるPE300シーケンシング
シーケンシングデータは標準ファイル形式でご提供
カスタムバイオインフォマティクスデータ解析が可能
データストレージサービスが利用可能
クオリティスコアQ30≥80%(選択されたシーケンス方法による)
推奨されるシーケンスカバレッジは、サンプルの複雑さによって異なります。
QC合格から約7～8週間納品
ラピートサービスが提供可能
サービス概要 - 16S/18S/ITS アンプリコンシーケンス解析
99%以上の天然微生物は分離や培養することができず、従来の分離・培養に依存する方法は自然環境における微生物研究は困難でした。
環境試料から直接回収された遺伝物質を用いたメタゲノム研究は、微生物の生物多様性を探る手法として、高度なNGS技術から大きな恩恵を受けています。16Sおよび18SrDNAは細菌および真菌の16Sまたは18SrRNA遺伝子の超可変領域で、ITS（Internal Transcribed Spacer）は細菌、真菌、古細菌の小サブユニットと大サブユニットrRNA遺伝子間のスペーサーDNAです。
16S/18S/ITS領域の配列比較は、少量のDNAからでもPCRで容易に増幅でき、近縁種間でも高い変異を持つため、分類学や分子系統学に広く利用されています。
仕様 - 16S/18S/ITS アンプリコンシーケンス解析
| サンプル種類 | ゲノムDNA： 量≥ 50ng 濃度≥ 6ng/μL |
|---|---|
| 解析法 | 標準データ解析： データのフィルタリング ペアエンドリードを重ね合わせ、タグを形成 タグはOTUにクラスタリングされます。PCA、ベン図。OTU数に基づいてランク曲線を作成 OTUアノテーションにより生物種を分類し、種プロファイルヒストグラム、ヒートマップ、系統樹を提供 単一サンプルのα多様性指標を作成 複数サンプルのβ多様性とクラスタリング解析を行う 比較分析は複数サンプルの有意差をスクリーニングするために使用 ※お客様のプロジェクトに合わせたカスタマイズバイオインフォマティクス解析が可能です。詳しくはお問い合わせください。 |
| 報告内容 | 標準ファイル形式で納品： FASTQ、.xls、.png |
| 目安納期 | QC合格から約7～8週間納品 |
| その他 | より詳しい情報に関しましては右上にある「製品ページ」のリンクをクリックしてご確認ください。: |
| メーカー希望小売価格(税別) | お問い合わせ下さい |
表示価格は代表的な仕様のものです。詳細はお問い合わせください。
注意事項
- 価格及び、サービスの仕様・内容などにつきまして、予告なしに変更されることがあります。
- 表示している参考価格に消費税等は含まれておりません。