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DNBSEQ™による長鎖ノンコーディングRNAシーケンス解析
P2BGJ1000021-1
製品の特長 - DNBSEQ™による長鎖ノンコーディングRNAシーケンス解析
サービス仕様
BGIの長鎖ノンコーディングRNAシーケンス解析サービスは、DNBSEQ™ プラットフォームで実行され、優れたデータ品質を低コストかつ短納期で実現します。
PE100
rRNAを除去したストランド特異的ライブラリー
シーケンシングデータとバイオインフォマティクス解析は標準ファイル形式（FastQ）でご提供
Dr.Tom システムによる高度なRNA データ可視化とデータマイニング
クオリティスコアQ30≥80%
サービス概要 - DNBSEQ™による長鎖ノンコーディングRNAシーケンス解析
長鎖ノンコーディングRNA（lncRNA）は、長さが200塩基以上を持ち、かつタンパク質をコードしないRNAを指します。ヒトの場合、lncRNAは約3万種
類の転写産物を含むと考えられ、ノンコーディング転写産物の主要部分を占めています。lncRNAの発見はまだ新規領域であり、これまで、lncRNAのごく一部しか研究されていません。lncRNAを機能によって分類
することは可能ですが、新しいlncRNAの機能を予測することはまだ困難です。
仕様 - DNBSEQ™による長鎖ノンコーディングRNAシーケンス解析
| サンプル種類 | 様々な生物種のトータルRNA、血液、細胞株、FFPE、新鮮凍結組織のサンプルを以下の条件で処理することができます。 一般的な要件： 純度：OD260/280 ≥ 2.0、OD260/230 ≥ 2.0、分解およびDNAの混入がないこと。 |
|---|---|
| 解析法 | 標準データ解析： mRNAおよびLncRNAの同定 定量化および差次的発現遺伝子（DEGs）の解析 GO解析およびパスウェイエンリッチメント（pathway enrichment）解析 DR.TOMシステム分析： 転写因子予測（AnimalTFDB/PlantTFDB） GSEA解析 Rfam、Pfam、Reactome、COG、EggNOGおよびInterProのアノテーション miRNAとmRNAの相互作用、IncRNAとmRNAの相互作用の解析 タンパク質間相互作用(PPI)解析 共発現相互作用ネットワーク解析 カスタムデータセットテーブルのアップロード |
| 報告内容 | 標準ファイル形式で納品：FASTQ、BAM、Excel |
| 目安納期 | QC合格から約5～6週間納品 • ラピートサービスが提供可能 |
| その他 | より詳しい情報に関しましては右上にある「製品ページ」のリンクをクリックしてご確認ください。: |
| メーカー希望小売価格(税別) | お問い合わせ下さい |
表示価格は代表的な仕様のものです。詳細はお問い合わせください。
注意事項
- 価格及び、サービスの仕様・内容などにつきまして、予告なしに変更されることがあります。
- 表示している参考価格に消費税等は含まれておりません。