PAGETOP

製品の特長 - High Resolution 16S rRNA解析

今まで解析が困難とされていた超微量な細菌叢の種レベル解析を実現する16S rRNA 解析

超微量な細菌叢解析を実現するために最適化された独自のプロトコールを開発

様々なサンプル形態および生物種での解析実績あり

種レベルで菌叢の割合を推定可能。これまで他社で解析が困難であった菌叢解析の実績もあり

再現性の高い解析結果を提供。本技術を用いた臨床検査「子宮内フローラ検査」は累積350施設以上で導入され、30,000検体以上を解析(2023年11月末社内データ)

研究計画のコンサルティングや統計解析なども対応可能(要相談・別途費用)

サービス概要 - High Resolution 16S rRNA解析

超微量バイオマス試料の解析に最適化された独自のプロトコールをご提供いたします。

【プロトコールの概要】

DNA抽出

 お預かりした検体よりDNAを抽出します。DNAの品質に問題がある際はご連絡させて頂く場合がございます。

PCR / ライブラリ調整

 16S rRNA遺伝子領域(V1-V2領域)のPCR増幅、精製、ライブラリ調整を行います。

シーケンス

 次世代シーケンサーを用いて、DNA配列の決定をします。

データ解析

 バイオインフォマティクスツールを用いて種レベルでの菌叢同定とその割合を推定し、解析結果を納品いたします。オプションにて統計解析や論文用のFigの作成も承ります。

仕様 - High Resolution 16S rRNA解析

サンプル種類ヒトおよび動物由来の菌叢を含む検体(子宮、腟、卵巣、羊水、口腔内、精液、髄液、母乳など)、グラム染色スライドガラス、FFPE切⽚、食品・サプリメント
解析法16S rRNA アンプリコン解析(細菌叢解析)
報告内容標準的な結果報告書の納品形式:Fastq データ、Excel データ 追加オプション:二次解析で多様性解析や、菌占有率を用いた比較解析 ※結果報告の納品形式はヒアリングの時にお伺いします。
目安納期20 営業日(標準) ※特殊な解析な場合は要相談
その他サンプル種類に記載ない形態の検体につきましても、お気軽にご相談ください。:
【解析事例】:
薬やサプリメントの効果測定に:
→不妊患者に対するラクトフェリン摂取前後の 子宮内細菌叢の変化を検討:
習慣と細菌叢との影響の調査、解明に:
→生活習慣や食生活が 生殖器内細菌叢に与える影響を調査:
病理切片から遡及的に癌、感染症などの原因菌の解明に:
→ホルマリン固定組織を用いた細菌叢解析 により、疾患の原因菌を同定:
保管してあるグラム染色スライドによる細菌叢解析に:
→9 年前のグラム染色スライドガラスからの腟内細菌叢解析:
メーカー希望小売価格(税別)35,000円〜
表示価格は代表的な仕様のものです。詳細はお問い合わせください。
メーカーVarinos
販売元Varinos
メーカーサイト製品ページ
カタログダウンロード

※リンク先で情報を閲覧する際に、ログイン・フォーム入力等を求められる可能性がございます。

Whole Genome Varinos High Resolution 16S rRNA解析

  • DNA抽出と増幅、データ解析の工程は超微量な細菌叢を解析するために弊社が独自で開発したプロトコールを使用しています。
  • 様々なサンプル形態および生物種での解析実績があります。例えば子宮、腟、卵巣、羊水、口腔内、精液、髄液、母乳の菌叢解析、グラム染色スライドガラス、FFPE切⽚、食品・サプリメントなどの実績があります。
  • ①:不妊患者に対するラクトフェリン摂取前後の 子宮内細菌叢の変化を検討
②:生活習慣や食生活が 生殖器内細菌叢に与える影響を調査
➂:ホルマリン固定組織を用いた細菌叢解析 により、疾患の原因菌を同定
④:9 年前のグラム染色スライドガラスから腟内細菌叢を解析

注意事項

  • 価格及び、サービスの仕様・内容などにつきまして、予告なしに変更されることがあります。
  • 表示している参考価格に消費税等は含まれておりません。