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超微量バイオマス試料の解析に最適化された独自のプロトコールをご提供いたします。
【プロトコールの概要】
DNA抽出
お預かりした検体よりDNAを抽出します。DNAの品質に問題がある際はご連絡させて頂く場合がございます。
PCR / ライブラリ調整
16S rRNA遺伝子領域(V1-V2領域)のPCR増幅、精製、ライブラリ調整を行います。
シーケンス
次世代シーケンサーを用いて、DNA配列の決定をします。
データ解析
バイオインフォマティクスツールを用いて種レベルでの菌叢同定とその割合を推定し、解析結果を納品いたします。オプションにて統計解析や論文用のFigの作成も承ります。
サンプル種類 | ヒトおよび動物由来の菌叢を含む検体(子宮、腟、卵巣、羊水、口腔内、精液、髄液、母乳など)、グラム染色スライドガラス、FFPE切⽚、食品・サプリメント |
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解析法 | 16S rRNA アンプリコン解析(細菌叢解析) |
報告内容 | 標準的な結果報告書の納品形式:Fastq データ、Excel データ 追加オプション:二次解析で多様性解析や、菌占有率を用いた比較解析 ※結果報告の納品形式はヒアリングの時にお伺いします。 |
目安納期 | 20 営業日(標準) ※特殊な解析な場合は要相談 |
その他 | サンプル種類に記載ない形態の検体につきましても、お気軽にご相談ください。: 【解析事例】: 薬やサプリメントの効果測定に: →不妊患者に対するラクトフェリン摂取前後の 子宮内細菌叢の変化を検討: 習慣と細菌叢との影響の調査、解明に: →生活習慣や食生活が 生殖器内細菌叢に与える影響を調査: 病理切片から遡及的に癌、感染症などの原因菌の解明に: →ホルマリン固定組織を用いた細菌叢解析 により、疾患の原因菌を同定: 保管してあるグラム染色スライドによる細菌叢解析に: →9 年前のグラム染色スライドガラスからの腟内細菌叢解析: |
メーカー希望小売価格(税別) | 35,000円〜 |
注意事項