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製品の特長 - Virome(ウイルス叢)の網羅的解析

ヒト検体に含まれるウイルス種の網羅的検出を行います。

DNA/RNAウイルスが混在した核酸からのライブラリー調製

ヒト全ゲノムシーケンス(WGS)およびRNA-Seqデータから独自のノウハウで宿主ゲノムの除去・フィルタリングを行うことで、高精度なウイルス種の検出が可能に

宿主ゲノムに挿入されたウイルスの挿入位置を検出

取得済みヒトWGSまたはRNA-Seqデータを用いたウイルス検出も可能に

概要 - Virome(ウイルス叢)の網羅的解析

ウイルスが混在した核酸から、目的ウイルス種(ssDNA/dsDNA/ssRNA/dsRNAウイルス)に合わせたライブラリー作製を行い、全ゲノムシーケンス・RNA-Seqを行います。

ヒト全ゲノムシーケンス・RNA-Seqデータから宿主ゲノム(ヒトゲノム)を除去した非宿主シーケンスデータを抽出し、メタゲノムデータベースを用いて生物種分類を行い、ウイルス種カウントリストを作成します。検出されたウイルス種のゲノム参照配列にシーケンスデータを再マッピングし、偽陽性でないことを確認することで解析結果の精度を高めます。同時にウイルスゲノムが宿主ゲノムに挿入されている場合(プロウイルス)、その挿入位置を検出します。

仕様 - Virome(ウイルス叢)の網羅的解析

サンプル種類お問合せ
解析法次世代シークエンス
報告内容作業報告書 シーケンスデータ一式 解析データ一式
目安納期お問合せ
その他該当項目: なし
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メーカータカラバイオ
販売元タカラバイオ
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