製品の特長 - 血漿/血清のプロテオミクス
高濃度タンパク質群の除去処理を含む試料調製
LC-MS/MSと配列データベース検索による信頼性の高い同定結果。
比較に供する試料の数に上限がないので、研究の目的と規模に合わせて最適の分析計画を立てることができる。
LC-MS/MSではモノリスのメートル長カラムを接続。
質量分析による血漿/血清タンパク質群の同定と計量 - 血漿/血清のプロテオミクス
血液中の液体成分である血漿/血清は、バイオマーカー探索のターゲットとして現在までにさまざまなプロテオミクスのアプローチが採られています。当社では、血中の微量タンパク質を定量的かつ高感度で検出するために、血清アルブミンや免疫グロブリンなどの高濃度タンパク質を除去する手法を整備してきました。
仕様 - 血漿/血清のプロテオミクス
サンプル種類 | ・ヒト血漿および血清
分析の目的などによってはヒト以外も可能な場合があります。ご相談ください。 |
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解析法 | 次の手順で分析します。
1. 抗体充填カラムを用いた高濃度タンパク質群の除去処理
2. プロテアーゼによるタンパク質の分解
3. ショットガン分析 (LC-MS/MS)
4. LC-MS/MSデータ間のタンパク質計量比較、および配列データベース検索によるタンパク質の同定 |
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報告内容 | ・タンパク質とペプチド断片の各同定計量一覧 (.xlsx)
・分析報告書 (.pdf)
・分析結果の説明資料 (.pptx)
分析結果を取得次第、オンライン会議などを通じて報告いたします。 |
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目安納期 | 約2か月 |
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その他 | 該当項目: なし
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メーカー希望小売価格(税別) | 270,000円〜 |
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表示価格は代表的な仕様のものです。詳細はお問い合わせください。
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血漿/血清プロテオミクスの実施例
製薬企業との共同研究です。抗がん剤ゲフィチニブの副作用予測因子を患者血漿から同定しました(Nyberg F et al., PLoS One. 2011; 6(7): e22062.)。
プロテオームデータ解析のワークフロー
現在のプロテオミクスが取り扱う情報の量は、質量分析計や各種分離技術の発展に伴ってますます膨大になっています。メディカル・プロテオスコープでは、受託分析を通じてプロテオームの測定データを処理・解析するためのノウハウを蓄積しています。単なるタンパク質同定計量一覧の提供にとどまらず、適切な解析ソフトウェアを用いて重要な候補タンパク質の「見える化」をサポートします。
タンパク質同定計量情報の可視化の例
MAプロット(左)とボルケーノプロット(右)の例を挙げます。いずれの散布図もプロテオームデータ全体を概観するときに便利です。また、候補タンパク質を計量的に絞り込む際の表現方法としても有用です。
ペプチド単位で散布図を作成することも可能です。