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製品の特長 - 【菌叢解析】 生体関連アンプリコンシーケンス解析
製品の特長-腸内細菌叢／皮膚菌叢／口腔内細菌叢の解析
マイクロバイオーム解析の受託サービス。
優れたコストパフォーマンス税別18,000円／サンプル～。
細菌、アーキア、菌類叢の解析に対応。
糞便や唾液なとサンプルをそのまま受け入れ可能。
ヒトや実験動物など様々な生物由来のサンプルに対応。
RNAの解析にも対応。
納品データは学術論文での利用実績多数。
α、β多様性解析、主成分分析、クラスター解析なども追加実施可能。
概要 アンプリコンシーケンス解析による細菌叢・菌類叢の解析 - 【菌叢解析】 生体関連アンプリコンシーケンス解析
腸内細菌叢（腸内フローラ）解析、皮膚常在菌叢解析、口腔内細菌叢解析など様々な試料中のマイクロバイオーム解析を受託するサービスです。DNAやRNAの抽出、PCR、シーケンス、データ解析を一括で承ります。
仕様 - 【菌叢解析】 生体関連アンプリコンシーケンス解析
| サンプル種類 | A区分：糞便、腸管内容物、 ルーメン液など B区分：唾液、プラーク、皮膚拭取物など （区分によって価格が異なります） |
|---|---|
| 解析法 | 【解析の流れ】 DNA／RNA抽出 → PCR増幅 → 精製 → シーケンス → クオリティフィルタリング → データ解析 【解析領域】 細菌：V1～V2、 V3～V4 細菌／ア ーキア一括：V3～V4 アーキア：V3～ V4 皮膚菌叢解析用：V3～ V4 菌類：ITS2 【シーケンス】 MiSeq® ( Illumina )によるペアエンドシーケンス 約10,000リードを取得し占有率の低い分類群も検出 【データ解析】 以下の2種類の解析ソフトウェアから選択可能 ○セット1：Metagenome@KIN データベース（細菌・酵母）：RDP＋テクノスルガ・ラボ 微生物同定データベース データベース（真菌）：RDP ○セット2：QIIME2 データベース（細菌・酵母）：Greengenes / SILVA database データベース（真菌）：UNITE |
| 報告内容 | 【セット1】 シーケンス生データ(fastq) ／ クオリティーフィルタリングおよびキメラチェック後のシーケンスデータ(fasta) ／ データ解析結果(csv、 html) 【セット2】 シーケンス生データ(fastq) ／ QIIME2 出力データファイルデータ解析 ／ 代表配列とリード数の一覧(csv) ／ 相同性検索結果の表及びバーチャート(qzv) 注 多様性解析や統計解析は含みません。別途追加の解析で承ります。 ／ ご依頼内容やサンプル数によって納品されないファイルがあります。 |
| 目安納期 | お問い合わせ下さい |
| その他 | サンプルの送付方法: 冷凍や冷蔵など、菌叢変化が少ない方法でご送付ください。糞便の場合冷凍推奨です。糞便、唾液、皮膚拭取物については、当社採取キットを使うと菌叢変化を防ぎつつ冷蔵で保管・輸送が可能です。 絶対定量について: 菌叢解析により得られる結果は特定の菌群の存在比であり絶対量ではありません。リアルタイムPCRを併用することで、DNA量という形で微生物の絶対量も定量できます。 データ解析のみも受託可能: fastqデータをお預かりしてのデータ解析も承りますのでご相談ください。 |
| メーカー希望小売価格(税別) | 18,000円〜 |
表示価格は代表的な仕様のものです。詳細はお問い合わせください。
注意事項
- 価格及び、サービスの仕様・内容などにつきまして、予告なしに変更されることがあります。
- 表示している参考価格に消費税等は含まれておりません。