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製品の特長 - 次世代シーケンス ターゲットアンプリコン解析パッケージ

データ解析までパッケージ化されたリーズナブルなプランをご用意。DNA抽出からもお引き受け可能です。

微生物群集構造解析をはじめとしたメタバーコーディング、ゲノム編集による遺伝子改変後の遺伝型解析(ジェノタイピング)などに利用可能です。解析対象領域は問いません。

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解析対象領域の例:

16S V4/18S V9/ITS(gITS7-ITS4)/COI(mICOIintF-HCO2198)/12S(MiFish)

メタバーコーディング領域はじめ、プライマー配列をご指定いただければ、どんなターゲットでも対応可能! - 次世代シーケンス ターゲットアンプリコン解析パッケージ

ファスマック社のNGS解析担当者宛にサンプル数、解析対象領域、サンプル形態(Raw sampleであればその内容*例えば土壌など*)をメールに記載して頂きご連絡ください。

E-mail:ngs@fasmac.co.jp

その後、お見積書をお送りさせて頂きますので、内容がよろしければ見積番号とともにご注文ください。

DNA抽出から弊社にご依頼されたい場合には専用容器、ライブラリ調製までお客様の方で実施いただく場合には専用プライマーを無償で提供いたします。

仕様 - 次世代シーケンス ターゲットアンプリコン解析パッケージ

サンプル種類抽出DNA(10ng/µl以上、20µl以上推奨)、ライブラリ調製済みサンプル*1stPCR産物からも承ることは可能ですのでご相談ください。
解析法Miseq 他
報告内容作業報告書 シーケンスデータ一式 解析データ一式
目安納期15営業日(オプションなし、ライブラリ調製済みサンプル受け入れの場合)
その他○基本料金 : 150,000円/16サンプル(10万円/8サンプル)
○オプションサービス:
DNA抽出から : 8サンプルまで ¥40,000、9~16サンプル ¥60,000
PCRから : 8サンプルまで ¥20,000、9~16サンプル ¥30,000
解析対象領域長の変更 : 400 base未満 無料、400~500 base程度 ¥20,000
Library Mix調製 : 16サンプルまで 無料、16サンプルあたり ¥30,000
レアファクションカーブと主座標分析(PCoA) : 1グループ ¥10,000
OUTのBLAST解析 : ¥30,000
SILVA databaseへの変更 : 無料
QIIme2での解析への変更 : 無料
納品後データの再解析 : QIIME使用 ¥1,000/サンプル、レアファクションカーブと主座標分析(PCoA) ¥30,000/グループ
メーカー希望小売価格(税別)お問い合わせ下さい
表示価格は代表的な仕様のものです。詳細はお問い合わせください。
メーカーファスマック
販売元グライナー・ジャパン
メーカーサイト製品ページ16SrRNAアンプリコン解析事例ジェノタイピング解析事例
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16SrRNAのV4領域のデータを用いた微生物群集構造解析の結果(門レベルの分類)

16SrRNAのV4領域のデータを用いた微生物群集構造解析の結果(門レベルの分類)

  • 16SrRNAのV4領域のデータを用いた微生物群集構造解析の結果(門レベルの分類)
  • COIアンプリコン解析の結果。ブロッキングプライマーを用いることで、ホスト由来DNAの増幅を抑制することができ、餌生物の検出解像度を飛躍的に上げることができます。野生生物の食性解析に有効です。
  • MiFish(12S)による相模水系の異なる時期での魚類相の解析結果。左図はPCR反復数と検出される魚種数の関係を示したグラフで、検出される魚種数を増やすためにPCR反復が有効であることが示唆されました。
  • CRISPR/Casでゲノム編集した培養細胞株からDNA抽出後、ターゲットアンプリコンシーケンスをMiseqにて実施。得られたデータをCrispRvariantにて解析しました。次世代シーケンスを利用することでより高い解像度でジェノタイピングを行うことが可能です。

注意事項

  • 価格及び、サービスの仕様・内容などにつきまして、予告なしに変更されることがあります。
  • 表示している参考価格に消費税等は含まれておりません。