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製品の特長

特長

低価格・高品質なシーケンシング

Wet/Dry双方に精通した研究員による事前の技術相談

カスタムメイドでの応用的なバイオインフォマティクス解析もご相談可能

サービス内容

【概要】

次世代シーケンサーを用いた遺伝子発現の網羅解析を実施します。

 

・既知遺伝子の発現定量解析

・未知の発現領域同定と定量

・スプライシングバリアントや融合遺伝子の検出

【ご依頼方法】

サンプル数、生物種の情報とともにお問い合わせください。

ライブラリー調製方法は下記より選択いただけます。

・真核生物 Poly-A選択法, Strand-specific

・真核生物 rRNA除去法, Strand-specific

・真核生物 微量サンプル(SMART-Seqキット使用)

・原核生物 rRNA除去法,Strand-specific

【マイクロアレイとの違い】

特定のRNA配列をキャプチャーするマイクロアレイとは異なり、RNA-seqは転写産物を網羅的に検出することができます。転写産物全体の配列を調べることで未知のmRNAアイソフォームやスプライシングを含めた多くのRNA情報を得られる方法として汎用性が高く、比較可能な公共データが豊富に存在します。

【データ解析】※ご要望のお客様のみ

お客様の研究目的、ご要望に応じて解析内容をデザイン可能です。

・データQC

・リードクリーニング

・マッピング

・リードカウント

・FPKM値/FPKM-UQ値/TPM値の算出

・相関分析

・主成分分析

・階層的クラスタリング

・ヒートマップ描画

・群間比較解析

 -発現変動遺伝子解析(DEG)

 -Volcano Plot, MA plot描画

 -DEG後ヒートマップ描画

 -GeneOntology解析

 -IPAパスウェイ解析

・GSEA解析

・スプライシング解析

・上流因子解析

・融合遺伝子解析

・Transcript SNP解析

・De novo RNA-seq

仕様

サンプル種類total RNA,凍結組織,凍結細胞,raw data
解析法RNA-seq(Poly-A選択法,rRNA除去法.微量サンプルなど多様な目的に対応)
報告内容fastqデータ,解析データ,作業完了報告書,Figureなど
目安納期データ取得:サンプル受領より4週~|データ解析:お問い合わせ
その他多検体でさらにディスカウントいたします。ご希望のデータ量により料金は異なります。:
メーカー希望小売価格(税別)お問い合わせ下さい
表示価格は代表的な仕様のものです。詳細はお問い合わせください。
メーカーRhelixa
販売元Rhelixa
メーカーサイト製品ページ
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バイオインフォマティクス解析も強力にサポートします。

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