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製品の特長 - siRNA設計 Gene Swatter siRNA

Gene Swatter siRNA デザイン法

配列設計には、三菱スペース・ソフトウェア株式会社との提携により、siRNA配列設計専用ソフト「siSNIPER」を使用します。

「siSNIPER」では、siRNAを5つの指標でスコア化し、それらを総合することによって高精度な遺伝子抑制効果の予測を実現しています。

siSNIPER:siRNA配列設計システムです。

Profile Score : 活性のあったsiRNAに共通する配列の特徴を表すプロファイルを利用します。

Load Score : siRNA内部のエネルギー安定性により生じる偏りを利用します。

GC Score : 実験データから得られたsiRNAのGC含有率と活性の高さとの関係によりスコア化します。

Position Score : ターゲットのmRNA中での位置と活性の高さとの関係によりスコア化します。

Specificity Score : ゲノム中での配列の特異性をスコア化して、Off-target effectを回避します。

概要 - siRNA設計 Gene Swatter siRNA

siRNAの設計は、RNAi実験を行う上で非常に重要な要素の一つとなっています。

本サービスでは、高度なアルゴリズムにより標的遺伝子に対するsiRNAの配列をデザインし、2本のPAGEグレードsiRNAの合成行ったうちのいずれか1本がmRNAレベルで70%の抑制を示すことを保証した"Gene Swatter siRNA"をご提供いたします1。ご提供したsiRNAがいずれもmRNAレベルで70%以上の抑制を示さなかった場合は無償で再デザイン・再合成を行います2, *3。

もちろん、デザインしたsiRNAの配列情報は全てお知らせいたします。

*1:標的遺伝子の配列によっては、mRNAレベルで70%の抑制を示す配列をデザインすることが出来ない場合があります。この場合、詳細をご報告してご相談させていただきます。

*2:納品後、3ヶ月以内にご使用いただいたsiRNAが対象となります。

*3:再デザイン・再合成を行う場合には、以下のデータをご提供いただき、ニッポンジーンにて検討をさせていただきます。

a) 発現効率を示すReal-Time PCRまたはノーザンブロッティングなどのデータ

b) コントロールsiRNAなどを用いたトランスフェクション効率についてのデータ

c) その他、こちらより必要と思われるデータについてお伺いする場合があります。

仕様 - siRNA設計 Gene Swatter siRNA

サンプル種類siRNA設計
解析法該当項目: なし
報告内容凍結乾燥・アニーリング済み
目安納期12営業日
その他合成鎖長: 21 bases
保証収量: 各6 O.D. (2 O.D. x 3)
添付バッファー: 各RNase free water x 1 mL
メーカー希望小売価格(税別)102,000円
表示価格は代表的な仕様のものです。詳細はお問い合わせください。
メーカーニッポンジーン
販売元富士フイルム和光純薬
メーカーサイト製品ページsiSNIPERの詳細
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ゲノム編集 ニッポンジーン siRNA設計 Gene Swatter siRNA

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