# サービスの概要
CircRNAは、linear-RNAとは異なり、共有結合で閉じたループ構造を形成するRNAであり、その一部は真核生物の転写産物中に高く発現し、しばしば組織・発生段階特異的な発現を示しています。また、CircRNAはLinear-RNAと比較してヌクレアーゼに対して安定性が高く、新規バイオマーカーとして臨床的な観点からも非常に注目されています。さらにCircRNAは、様々な生物種において、天然のmiRNAスポンジ転写物、いわゆる競合内在性RNA (ceRNA)として機能することが明らかにされています。

Arraystar社のcircRNA Arrayは、CircRNAのループ構造を形成するCircular junction特異的なプローブ設計およびLinear-RNAを除去することにより、より個々のCircRNAを確実かつ正確に同定可能です。そのため、本解析サービスは様々な観点から注目されているCircRNA を最も効果的にプロファイルおよび解析、探索を提供します。


# サービスの概要
N6-メチルアデノシトシン (m6A) および 5-メチルシチジン (m5C) などのRNA修飾は転写後の遺伝子制御つまりエピトランスクリプトーム、および遺伝子発現制御に深く関係しています。この二つのメチル化はmRNAおよびLncRNAにおいて、豊富な内部修飾となっており、転写後mRNA/LncRNA代謝、および機能のあらゆる局面に影響を与えます。さらに、m6Aは、キャップに依存しないCircRNAの翻訳開始やPrimary microRNA(pri-miRNA)のプロセシングなど、他の多くのncRNAの機能にも関与しています。

Arraystar社のEpitranscriptomic Array解析では、メチル化RNA免疫沈降法 (MeRIP)と2色チャンネルマイクロアレイ技術を組み合わせ、修飾および未修飾のRNAを比較することができ、転写産物をアイソフォーム特異的にRNAの修飾レベルの割合を定量化します。この解析手法により、mRNAとLncRNAまたはCircRNAのトランスクリプトームワイドのRNA修飾プロファイリングをご提供いたします。


# サービスの概要
Long non-coding RNA(LncRNA)は、タンパク質をコードしない200塩基長のRNAであり、転写や分化制御などの生物学的プロセスやがんや心疾患などヒトの疾患に大きく関与しています。

ArrayStar社のLncRNA Arrayは、LncRNAおよびタンパク質コードmRNAを体系的にプロファイリングする様デザインされており、本解析は複雑なLncRNA生物学の解明やタンパク質コード遺伝子との関連性について、非常に重要な解析データを提供します。また、このアレイは、包括的かつ厳密に収集された最高のLncRNAコンテンツ (Reliable LncRNA)を有し、十分に実験的に裏付けのあるデータソース(Gold Standard LncRNA)を利用することで、RNA-Seqよりも優れたLncRNAプロファイリングデータを提供します。また本解析はサンプルのQCチェックから分析および解析までフルパッケージのサービスとなっております。


# サービスの概要
Small RNAにおける8-オキソグアニン(o8G)、7-メチルグアノシン (m7G)、N6-メチルアデノシン (m6A)、シュードウリジン (Ψ)、および5-メチルシチジン (m5C)などの修飾は、miRNAの生合成、標的mRNAとの二重鎖形成、tRNAの安定性、および疾患のバイオマーカーとして機能します。例えば、miRNAにおけるm6A修飾は正常組織と比較して、腫瘍組織で著しく増加することが報告されており、血清中のm6A修飾miR-17-5pレベルは、極めて高い感度と特異性で早期膵臓癌を検出します。そのため、Small RNAにおける修飾の解析は生物学的プロセスおよび疾患理解に非常に重要であります。

Arraystar社のSmall RNA　modification Array受託解析サービスは、 miRNA、pre-miRNA、tsRNA由来のSmall RNA (tsRNA、tRNA-derived fragments（tRFs）および tRNA halves（tiRNAs）を含む)におけるo8G、m7C、m6A、 Ψ、m5Cの修飾を免疫沈降法とマイクロアレイ技術によって網羅的に検証することが可能な受託解析サービスとなっており、また、本解析はご準備いただくサンプルのQCチェックからマイクロアレイ解析、およびバイオインフォマティクス解析までフルパッケージのサービスとなっております。


# サービス概要
マイクロアレイ発現解析と同様に、各 miRNA のシグナル強度（数値）をご報告します。

さらに、差のある miRNA については、TargetScan を用いて 各miRNAが制御する可能性のあるターゲット候補の遺伝子リストをご報告します。



TargetScan 等で知ることのできるmiRNAのターゲット候補は、1miRNAあたり514～1519 遺伝子にもおよびます。ターゲット候補遺伝子のリストについては、DAVID等に用いることで機能解析をすることが可能です。



また、miRNA アレイ解析によって有意に変動があった miRNA 群の全体のターゲット候補は、20,000遺伝子にもおよぶことがあります。このような膨大な候補が挙がった場合には、同じRNAサンプルを用いて、別途発現解析のデータを取得して発現変動遺伝子との共通遺伝子を絞り込むことも可能です。


# サービス概要
本サービスでは、数値の羅列であるマイクロアレイデータを、具体的な研究に“使える”データとしてご提供します！（論文に掲載する際のヒートマップの作成や、解析方法の記述、マイクロアレイデータの公開データベース NCBI GEO（Gene Expression Omnibus）への更新までサポートいたします。）



また、具体的な研究において有用な情報が得られていないマイクロアレイデータをお持ちでしたら、解析のみのサービスも実施しておりますので、ご相談ください。


# マイクロアレイ ～ コピー数変異（CNV） ～
ヒト全染色体レベルのコピー数変異解析用途としてGeneChip HD Arrayによるマイクロアレイ解析のサービスをご提案いたします。


# マイクロアレイ ～ 遺伝子発現 ～
遺伝子発現のスクリーニング用途としてGeneChipによるマイクロアレイ解析のサービスをご提案いたします。様々な生物種、アレイを取り揃えております。


受託カタログ

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CircRNA Array受託解析サービス

Epitranscriptomic Array 受託解析サービス

Long non-coding RNA マイクロアレイ受託解析サービス

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マイクロアレイ～コピー数変異（CNV）～

マイクロアレイ～遺伝子発現～