# その他アレイ解析サービス
■CGHアレイ解析サービス

1.特長

・ヒト、マウス、ラットなどのモデル生物について、全ゲノムを高密度に解析可能です。

・ヒト用にはゲノムワイドの他にも、ISCA 標的領域・CNV 領域・疾患関連領域にフォーカスした多彩なラインナップが用意されています。

・納品はRaw データでのご提供となります。

2.サービス内容

・サンプル品質検査

・アレイ解析

・スキャン・数値化

■miRNAアレイ解析サービス

1.特長

・mature なmiRNA を選択的に検出します。

・Total RNA 中のmiRNA を直接ラベリングするので、small RNA 精製などの手間が不要です。

・オプションでRNA 抽出、データマイニングの各種サービスもご利用いただけます。

2.サービス内容

・アレイデザイン（オプション）

・RNA抽出/精製（オプション）

・アレイ解析

・スキャン・数値化

・データマイニング（オプション）


# 検体条件
お客様より送付いただいた血液、唾液、またはDNA検体をジャポニカアレイ®にアプライしSNPのジェノタイピングを実施後、その解析結果をご提供します。

■検体条件

・96検体をサービスの単位としております。

・解析する検体は、お客様が自己の費用と責任において、事前に提供者からのインフォームドコンセントを取得していることおよびお客様がご自身の倫理審査委員会の審査・承認等 必要な手続きを得ていることを条件とさせていただきます。

●1.DNA抽出済検体の場合

検体を入れる容器は0.2 mL 96ウェルPCRプレートといたします。

ゲノムDNA濃度 ： ≧50 ng/µL

溶媒 （いずれも分子生物学グレード）

－Nuclease (DNase/RNase) -free water (DEPC-treated water は不可)

－Low TE buffer, pH 8.0 (10 mM Tris-HCl / 0.1 mM EDTA)

－TE Buffer, pH 8.0 (10 mM Tris-HCl / 1 mM EDTA)

送付容量 ≧20 µL (≧ 1.0 µg)

A260 / A280 ： >1.6

鎖長 ： ≧ 10 kbp

●2.全血、バフィーコート、細胞塊、細胞懸濁液の場合

送付容量 ： ≧ 1.0 mL

抗凝固剤 ： ヘパリン、CPD、EDTA

検体の形態 ： 全血、バフィーコート、細胞塊(1 x 10^7 Cells 以上)、細胞懸濁液(1 x 10^7 Cells 以上) 

●3.唾液検体の場合

送付容量 ： 2 mL(容器にある採取ラインまでの量)

送付容器 ： Oragene (OG-500)

唾液採取方法 ： Orageneが定める使用方法により採取


# サービスの概要
CircRNAは、linear-RNAとは異なり、共有結合で閉じたループ構造を形成するRNAであり、その一部は真核生物の転写産物中に高く発現し、しばしば組織・発生段階特異的な発現を示しています。また、CircRNAはLinear-RNAと比較してヌクレアーゼに対して安定性が高く、新規バイオマーカーとして臨床的な観点からも非常に注目されています。さらにCircRNAは、様々な生物種において、天然のmiRNAスポンジ転写物、いわゆる競合内在性RNA (ceRNA)として機能することが明らかにされています。

Arraystar社のcircRNA Arrayは、CircRNAのループ構造を形成するCircular junction特異的なプローブ設計およびLinear-RNAを除去することにより、より個々のCircRNAを確実かつ正確に同定可能です。そのため、本解析サービスは様々な観点から注目されているCircRNA を最も効果的にプロファイルおよび解析、探索を提供します。


# サービス説明
アジレント社のマイクロアレイは1枚のスライドに複数のサンプルを処理できるプラットフォームになっています。

搭載遺伝子数の違いによって、1枚のスライドで処理できるサンプル数が異なります（8x60K、4x44K、8x15K）。

解析結果はクラボウ独自のソフトウェア「Transcriptome Viewer」でご報告します。マイクロアレイデータの取り扱いが初めてという方にも、クラスタリングなどのグラフ作成、統計解析による発現変動遺伝子の抽出を簡便に行うことができます。


# 概要
mRNAなどの発現量を測定するマイクロアレイ データ解析を行います。アレイデータの正規化、発現変動解析、サンプルのクラスタリングを実施します。オプションでGO解析、パスウェイ解析も実行できます。

プローブデータベースがあるアレイであれば、様々な生物種に対応が可能です。お問い合わせください。


# サービス概要
本サービスでは、数値の羅列であるマイクロアレイデータを、具体的な研究に“使える”データとしてご提供します！（論文に掲載する際のヒートマップの作成や、解析方法の記述、マイクロアレイデータの公開データベース NCBI GEO（Gene Expression Omnibus）への更新までサポートいたします。）



また、具体的な研究において有用な情報が得られていないマイクロアレイデータをお持ちでしたら、解析のみのサービスも実施しておりますので、ご相談ください。


# 概要
マクロジェンは Agilent、illumina および Affymetrix の Chip を用いてマイクロアレイ解析サービスを提供しています。マクロジェンは、illumina 公式サービス指定会社のため、illumina から認定された正確なデータをお伝えできます。また、バイオインフォマティクスを基盤とした全般的な解析相談も承ります。


# ご提供いただくもの
サンプル ： Total RNA

サンプル量 ： 1µg以上

サンプル濃度 ： 0.5µg/µl以上（推奨）

純度 ： OD260/OD280=1.8～2.0

ご注意

・RNAの抽出方法は推奨するキットをご使用ください。

・遺伝子発現解析とmiRNA解析では推奨するキットが異なりますのでご注意ください。

・RNAサンプルはDNase-RNaseフリー水に溶解の上、必ず凍結状態で、冷凍便にてご送付ください（予めご相談させていただいた日時指定でご送付ください）。なお、輸送時のトラブルに関し、当社はその責任を負いかねます。

・感染性の高いサンプルはお受けできない場合がございます。ご了承ください。

・ご依頼いただくサンプルがヒトサンプルの場合、サンプル提供者のインフォームドコンセントを得てください。

・お預かりできるサンプルは、文部科学省が「遺伝子組換え生物等の使用等の規制による生物の多様性の確保に関する法律（通称：カルタヘナ法）」にて定めるP1レベルのものに限らせていただきます。

・サンプルは原則としてご返却いたしかねますので、ご了承ください。

・本受託解析は研究以外の目的（医療診断や医療用品・食品の製造・検査等）には使用しないでください。


受託カタログ

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アジレントアレイ解析

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