# 概要
LC/MS/MS は高速液体クロマトグラフ (HPLC) と質量分析計 （MS) を結合させた装置です。まず、サンプルを LC 部で親和性の差によって成分ごとに分離し、試料成分を 1 段目の MS でイオン化（ESI法）し、質量ごとにわけて（プレカーサイオン）、さらに分離されたイオンを衝突室 (コリジョンセル) 内でアルゴンガスに衝突させてイオンを解離させます (プロダクトイオン)。そのイオンを 2 段目の MS で検出する手法です。

本サービスではタンパク質を Trypsin で分解し、そのペプチド溶液を LC/MS/MS に供します。得られた MS/MS データを用いて Mascot 検索を行い、その結果をご報告いたします。ゲノムデータベースが公開されていない種由来のタンパク質を LC-MS/MS で解析する場合は、ゲノムが類似している生物種のデータベースからアミノ酸配列が類似しているタンパク質として同定できる可能性がございます。


# 概要
MALDI-TOF MASS とはマトリックス支援レーザー脱離イオン化法 （MALDI： Matrix Assisted Laser Desorption Ionization） と飛行時間型 (TOF： Time Of Flight） 質量分析装置 （MS） の組み合わせにより、高分子の質量を決定 することができる手法です。MALDI-TOF MASS による PMF (Peptide Mass Fingerprint) 解析はトリプシン処理によって切られたペプチドフラグメントの質量を測定し、これを Mascot サーチすることによりタンパク質を同定する解析法です。本サービスは Genomic sequence が完了している生物種または NCBI に登載されているタンパク質の同定に有効です。


# 概要
プロテオーム解析には二次元電気泳動と、質量分析という二つの重要な技術があります。二次元電気泳動法は等電点電気泳動と SDS 電気泳動のニつを組み合わせることにより、細胞内の全タンパク質を数千以上にもおよぶスポットに分離することができます。それぞれのスポット中のタンパク質をトリプシンで分解し、質量分析で解析することでペプチドの質量や部分配列情報が得られます。これらの情報をデータベース検索することでタンパク質の同定や様々な翻訳後修飾の分析が可能です。

Genomine 社は国内外で多数の解析実績を有しており、二次元電気泳動による試料間の比較解析から質量分析計によるタンパク質の同定までプロテオミクス研究を推進する解析一式をご提供致します。


# 概要
MALDI-TOF/TOF はイオン源としてマトリックス支援レーザー脱離イオン源を用い、2台の飛行時間型質量分析計を直列に接続したタンデム型の質量分析計です。MALDI-TOF 解析から出た MASS に対してもう一度 MS/MS解析をし、アミノ酸単位まで切られた mass 値を測定し、Mascot サーチによってタンパク質を同定する解析法です。Genomic sequence が完了していない生物種や数個のタンパク質が混ざっているサンプルの同定に有用に利用される方法です。ゲノムデータベースが公開されていない種由来のタンパク質を MALDI-TOF/TOF で解析する場合は、ゲノムが類似している生物種のデータベースからアミノ酸配列が類似しているタンパク質として同定できる可能性がございます。MS 解析の結果を論文に使用する場合は、近頃の著名なジャーナルでは MALDI-TOF/TOF 法や LC-MS/MS 法からのデータのみを認める状況です。


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