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製品の特長 - DNBSEQ™によるChlP-Seq解析

サービス仕様

BGIのChIP-Seq解析サービスは、優れたデータ品質を実現できるcPASおよびDNA Nanoballs(DNB™)テクノロジーを備えたDNBSEQ™テクノロジーで実行されます。

SE50

2,000万リード/サンプル

クリーンデータとバイオインフォマティクス解析は標準ファイル形式(FastQ)でご提供

データストレージとバイオインフォマティクスアプリケーションが利用可能

サービス概要 - DNBSEQ™によるChlP-Seq解析

ChIPシーケンシング(ChIP-Seq)は、タンパク質とDNAとの相互作用解析に広く用いられています。クロマチン免疫沈降法(ChIP)とハイスループットDNA

シーケンシングを組み合わせて、DNA結合タンパク質の結合部位を特定し、対象となるあらゆるタンパク質の全ゲノムにおける結合部位を正確にマッピングすることができます。ChIP-Seq解析は、マイクロアレイに基づくChIP-chipと比べ、より高い解像度および正確で豊富な情報を提供することができます。

BGIは、お客様の特定の研究ニーズに合わせて、標準的またはカスタマイズされたバイオインフォマティクスサービスを提供することが可能です。

コンフィダンス: HiSeqデータとの高い相関性

ローインプット: 5ng ChIP-ed DNA/サンプル(ヒトサンプルの場合)

統合的な解析: ChIP-SeqとRNA-Seqの相関解析

仕様 - DNBSEQ™によるChlP-Seq解析

サンプル種類①ChIP-ed DNA:量≥10ng、濃度≥1ng/μL、ボリューム≥15μL ②ChIP-ed DNA (ヒト):量≥5ng、濃度≥1ng/μL、ボリューム≥15μL
解析法標準データ解析: データフィルタリング 参照ゲノムへのアラインメント ピーク検出とアノテーション サンプル間で変動のあるピークの検出 グループ間で変動のあるピークの検出 変動のあるピークのアノテーション ※お客様のプロジェクトに合わせたバイオインフォマティクス解析をカスタマイズすることができます。お気軽にお問い合わせください。
報告内容標準ファイル形式で納品:FASTQ、Excel
目安納期•QC合格から約6週間
その他より詳しい情報に関しましては右上にある「製品ページ」のリンクをクリックしてご確認ください。:
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表示価格は代表的な仕様のものです。詳細はお問い合わせください。
メーカーBGI JAPAN
販売元BGI JAPAN
メーカーサイト製品ページ
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ワークフロー

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