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製品の特長 - DNBSEQ™による全ゲノムバイサルファイトシ-ケンス解析(WGBS)

サービス仕様

BGIのWGBS解析は、優れたデータ品質を実現できるcPASおよびDNA Nanoballs(DNB™)テクノロジーを備えたDNBSEQ™テクノロジーで実行されます。

ライブラリー調製、バイサルファイト処理を含む

PE100

データストレージとバイオインフォマティクスアプリケーションが利用可能

クオリティスコアQ20≥85%

99%以上のバイサルファイト変換率を保証

標準シーケンスカバレッジ≥30Xを推奨

サービス概要 - DNBSEQ™による全ゲノムバイサルファイトシ-ケンス解析(WGBS)

DNAのシトシンの5位のメチル化(5-メチルシトシン:5mC)は、安定したエピジェネティックな修飾であり、遺伝子サイレンシング、トランスポゾンの抑制、ゲノムインプリンティング、およびX染色体の不活性化など、多くの生物学的プロセスにおいて重要な役割を果たしています。メチル化の検出と定量は、遺伝子発現やエピジェネティックな制御を受けるその他のプロセスを解明する上で極めて重要です。

全ゲノムバイサルファイトシ-ケンス解析(WGBS)は、シーケンシングを行う前にDNAを重亜硫酸ナトリウムで処理することにより、メチル化シトシンを検出

します。

WGBSは、ゲノム全体にわたるメチル化を一塩基分解能で研究するためのゴールドスタンダードとなっています。

仕様 - DNBSEQ™による全ゲノムバイサルファイトシ-ケンス解析(WGBS)

サンプル種類①レギュラサンプル:インタクトなゲノムDNA≥1μg 、濃度≥50ng/μL、ボリューム≥15 μL; ②微量サンプル:インタクトなゲノムDNA≥100ng 、濃度≥7ng/μL、ボリューム≥15 μL
解析法標準データ解析: • データフィルタリング • アラインメント • データ品質統計 • メチルシトシンの同定 • DMR 解析(Differential Methylated Region) • メチル化レベルの統計 ※お客様のプロジェクトに合わせたバイオインフォマティクス解析をカスタマイズすることができます。お気軽にお問い合わせください。
報告内容標準ファイル形式で納品:FASTQ, BAM, cout, .xls, .png
目安納期•QC合格から約8週間 •ラピードサービスが提供可能(*詳細はお問い合わせください)
その他より詳しい情報に関しましては右上にある「製品ページ」のリンクをクリックしてご確認ください。:
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メーカーBGI JAPAN
販売元BGI JAPAN
メーカーサイト製品ページ
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ワークフロー

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