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製品の特長 - CUT&RUN-seq受託解析

特長

お客様の研究目的に沿って「モチーフ検出(別途有料オプション)」などの高次解析にも対応致します。

CUT&RUN-seq解析の実績豊富な専門家が中間・最終報告を実施し、解析結果を解釈も含め丁寧にご説明いたします。

概要 - CUT&RUN-seq受託解析

CUT&RUN (Cleavage Under Target & Release Using Nuclease) は、DNAとタンパク質の相互作用を解析する技術です。CUT&RUN-seqの高次解析をすることで、論文用の図表作成にご活用いただけます。また、中間報告では、解析結果をもとに最終的な解析方針を確認するため、想定通りの報告書を得ることができ、再依頼による時間・金銭的コストがかかりません。最終報告で解釈を含めて丁寧にご説明いたしますので、「結果の見方がわからない」といった困りごとを避けることが可能です。

受託解析サービスのご紹介 - CUT&RUN-seq受託解析

仕様 - CUT&RUN-seq受託解析

サンプル種類精製済みのDNA
解析法【WET】シーケンス ○ 免疫沈降済みのDNAからのライブラリ調製 ○ Illumina社 NovaSeq X Plus によるシーケンシング 【DRY】データ解析 6GB、150PE、non stranded RNA-seq) ○ 解析レポート、報告会(手法解説、結果解釈のディスカッション)、アフターフォロー(メールでのQ&A) ○ ピーク近傍遺伝子の可視化、アノテーション ○ リードカウントの定量解析:マッピング、リードカウントの定量、階層的クラスタリング(ヒートマップ描画)、 主成分分析 ○ 二群間の発現量比較解析(サンプル数によって組み合わせ数を決定):Volcano plot ○ エンリッチメント解析:Gene Ontology解析 ○ ピークコール、サンプル特異的なピークの集計、モチーフ解析
報告内容・データ解析結果報告書(PDF) ・クオリティーコントロール後データ(FASTQ) ・マッピング結果(Duplicate read除去後BAM) ・検出されたピーク(アノテーション後BED)
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その他該当項目: なし
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メーカーアメリエフ
販売元アメリエフ
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解析例

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