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CUT&RUN (Cleavage Under Targets & Release Using Nuclease) は、抗体とprotein A/G融合ミクロコッカスヌクレアーゼ (pAG-MNase) を利用して、転写因子やヒストン修飾などのクロマチン関連タンパク質のゲノム上の結合部位を解析する手法です。ChIP-Seqと異なり、ホルマリン固定やDNAとの架橋を必要としないため、架橋に伴うアーティファクトを抑えながら、少ない細胞数で高感度かつ高い特異性のある解析が可能です。また、バックグラウンドシグナルが低いため、少ないシーケンス深度でも高品質なデータを取得でき、ChIP-Seqと比較してシーケンスコストの削減も期待できます。サンプル量の制約からこれまでChIP-Seqが困難だった貴重な試料や少数細胞サンプルにも適しています。
アクティブ・モティフのCUT&RUN受託解析サービスでは、実験条件の提案からライブラリー調製、次世代シーケンス、バイオインフォマティクス解析までを一貫して提供し、転写因子結合やヒストン修飾の網羅的なプロファイリングを支援します。
| サンプル種類 | 哺乳動物細胞、組織、オルガノイド |
|---|---|
| 解析法 | CUT&RUN |
| 報告内容 | FASTQ / BAM / BigWig / QC / PCA解析 / 差次的比較解析 / モチーフ解析 / 作業報告書など |
| 目安納期 | 米国ラボに検体到着後5~6週程度 |
| その他 | 該当項目: なし |
| メーカー希望小売価格(税別) | お問い合わせ下さい |
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