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製品の特長 - CUT&RUN受託解析サービス

ChIPに代わる少数細胞の転写因子結合解析

ゲノムワイドな転写因子の結合領域同定

ChIP-Seq解析で推奨されるサンプル量よりも少ない量で解析可能

低いバックグラウンドシグナル

Input-Seqの必要なし

細胞や組織検体をご提出いただくだけで、比較解析やモチーフ解析などのバイオインフォマティクス解析まで一貫して実施 (End-to-endサービス)

様々な細胞種や組織についての解析実績

製品の概要 - CUT&RUN受託解析サービス

CUT&RUN (Cleavage Under Targets & Release Using Nuclease) は、抗体とprotein A/G融合ミクロコッカスヌクレアーゼ (pAG-MNase) を利用して、転写因子やヒストン修飾などのクロマチン関連タンパク質のゲノム上の結合部位を解析する手法です。ChIP-Seqと異なり、ホルマリン固定やDNAとの架橋を必要としないため、架橋に伴うアーティファクトを抑えながら、少ない細胞数で高感度かつ高い特異性のある解析が可能です。また、バックグラウンドシグナルが低いため、少ないシーケンス深度でも高品質なデータを取得でき、ChIP-Seqと比較してシーケンスコストの削減も期待できます。サンプル量の制約からこれまでChIP-Seqが困難だった貴重な試料や少数細胞サンプルにも適しています。

アクティブ・モティフのCUT&RUN受託解析サービスでは、実験条件の提案からライブラリー調製、次世代シーケンス、バイオインフォマティクス解析までを一貫して提供し、転写因子結合やヒストン修飾の網羅的なプロファイリングを支援します。

仕様 - CUT&RUN受託解析サービス

サンプル種類哺乳動物細胞、組織、オルガノイド
解析法CUT&RUN
報告内容FASTQ / BAM / BigWig / QC / PCA解析 / 差次的比較解析 / モチーフ解析 / 作業報告書など
目安納期米国ラボに検体到着後5~6週程度
その他該当項目: なし
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表示価格は代表的な仕様のものです。詳細はお問い合わせください。
メーカーアクティブ・モティフ
販売元アクティブ・モティフ
メーカーサイト製品ページ
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ETS1をターゲットとした際のCUT&RUNとChIP-Seqプロファイルの類似性

ETS1をターゲットとした際のCUT&RUNとChIP-Seqプロファイルの類似性

  • ETS1をターゲットとした際のCUT&RUNとChIP-Seqプロファイルの類似性
  • 転写因子をターゲットとした解析例
  • CUT&RUNワークフロー

注意事項

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  • 表示している参考価格に消費税等は含まれておりません。