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Single-Cell ATAC-Seq (scATAC-Seq) は、ATAC-Seqを1細胞レベルに拡張した解析手法で、個々の細胞におけるクロマチンアクセシビリティをゲノムワイドに解析し、細胞集団内の多様性や細胞亜集団を明らかにします。トランスポゼースを利用してオープンクロマチン領域を選択的にタグメンテーションすることで、遺伝子制御に関わるプロモーターやエンハンサーなどの活性制御領域を解析できます。
アクティブ・モティフのscATAC-Seq受託解析サービスでは、一度に数千個の細胞を解析し、従来のバルクATAC-Seqでは捉えることが難しかった細胞集団内のクロマチンアクセシビリティの違いや細胞亜集団を同定します。FACSや磁気選別などによって細胞をあらかじめ分離する必要がないため、細胞分離操作による生物学的状態への影響を抑えながら、試料中の細胞集団を包括的に解析できます。
薬剤応答に伴う細胞亜集団の変化や、細胞分化・発生過程におけるクロマチン状態の変化、腫瘍組織における特徴的な細胞集団の同定など、幅広い研究に活用できます。アクティブ・モティフでは、組織・細胞処理、トランスポゼース反応、10x Genomics Chromium Xによるサンプル処理、ライブラリー作製、次世代シーケンスからバイオインフォマティクス解析までをend-to-endでサポートします。
| サンプル種類 | 哺乳動物細胞、組織、オルガノイド |
|---|---|
| 解析法 | scATAC-Seq |
| 報告内容 | FASTQ / Cell Ranger ATAC解析結果 (Peak/Accessibility Matrix、Fragment File、BAM、QC Metrics等) / QC可視化 / 作業報告書など |
| 目安納期 | 米国ラボに検体到着後8~10週程度 |
| その他 | 該当項目: なし |
| メーカー希望小売価格(税別) | お問い合わせ下さい |
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