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製品の特長 - シングルセルATAC-Seq受託解析サービス

シングルセルレベルのオープンクロマチン解析

1細胞レベルでクロマチンアクセシビリティを解析

細胞種ごとの制御領域・クロマチン状態を解析

薬剤応答・分化・発生などに伴うクロマチン変化を解析

10x Genomics Chromium Xを用いたライブラリー調製

サンプル調製からシーケンス、解析までend-to-endで対応

Cell Ranger ATACによるクロマチンアクセシビリティ解析・QC結果を納品

製品の概要 - シングルセルATAC-Seq受託解析サービス

Single-Cell ATAC-Seq (scATAC-Seq) は、ATAC-Seqを1細胞レベルに拡張した解析手法で、個々の細胞におけるクロマチンアクセシビリティをゲノムワイドに解析し、細胞集団内の多様性や細胞亜集団を明らかにします。トランスポゼースを利用してオープンクロマチン領域を選択的にタグメンテーションすることで、遺伝子制御に関わるプロモーターやエンハンサーなどの活性制御領域を解析できます。

アクティブ・モティフのscATAC-Seq受託解析サービスでは、一度に数千個の細胞を解析し、従来のバルクATAC-Seqでは捉えることが難しかった細胞集団内のクロマチンアクセシビリティの違いや細胞亜集団を同定します。FACSや磁気選別などによって細胞をあらかじめ分離する必要がないため、細胞分離操作による生物学的状態への影響を抑えながら、試料中の細胞集団を包括的に解析できます。

薬剤応答に伴う細胞亜集団の変化や、細胞分化・発生過程におけるクロマチン状態の変化、腫瘍組織における特徴的な細胞集団の同定など、幅広い研究に活用できます。アクティブ・モティフでは、組織・細胞処理、トランスポゼース反応、10x Genomics Chromium Xによるサンプル処理、ライブラリー作製、次世代シーケンスからバイオインフォマティクス解析までをend-to-endでサポートします。

仕様 - シングルセルATAC-Seq受託解析サービス

サンプル種類哺乳動物細胞、組織、オルガノイド
解析法scATAC-Seq
報告内容FASTQ / Cell Ranger ATAC解析結果 (Peak/Accessibility Matrix、Fragment File、BAM、QC Metrics等) / QC可視化 / 作業報告書など
目安納期米国ラボに検体到着後8~10週程度
その他該当項目: なし
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メーカーアクティブ・モティフ
販売元アクティブ・モティフ
メーカーサイト製品ページ
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サブポピュレーション間のクロマチンアクセシビリティ変化の同定

サブポピュレーション間のクロマチンアクセシビリティ変化の同定

  • サブポピュレーション間のクロマチンアクセシビリティ変化の同定
  • バルク解析とシングルセル解析の違い

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