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DNAと転写因子の複合体を抗体で免疫沈降し、沈降したDNA断片をシーケンスすることで、DNAのどの領域が転写因子と相互作用していたのかを明らかにする手法です。
・ゲノム上の転写因子、ヒストン修飾の標的捕捉に
・疾患や細胞変化に関連する重要な転写因子の定義に
・RNA-seqとの統合解析に
■ATAC-seqとの違い
ChIP-seqはATAC-seqと異なり、特定の抗体を用いて免疫沈降を行うことで、特定の転写因子とDNAの相互作用部位を網羅的に明らかにすることが可能です。従い、特定の転写因子やヒストン修飾に興味が定まっている場合に有効な手法となります。
■受託解析プラン
・生データプラン
シーケンスにより取得したfastqデータ(生データ)のみを納品します。
・ベーシック解析プラン
基本解析を実施するプランです。種々の描画により、個別サンプル間のばらつきをスピーディに俯瞰頂けます。
・スタンダード解析プラン
ベーシックプランの解析内容に加え、ご希望の解析をオプションでお選びいただき実施するプランです。
・プレミアム解析プラン
お客様の研究分野に関する情報を頂き、論文化や事業化までの研究サポートを行うコンサルティングサービスです。
※プレミアムプランについてはプロジェクトの混雑状況によりお受けできない場合があります。ご了承ください。
【ご依頼方法】
以下の情報とともに、お問い合わせください。
(1) 解析対象の生物種
(2) サンプル数
(3) 受託解析プラン(生データ/ベーシック/スタンダード/プレミアム)
サンプル種類 | ChIP-DNA |
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解析法 | ChIP-seq |
報告内容 | fastqデータ,解析データ,作業完了報告書,Figureなど |
目安納期 | お問い合わせ下さい |
その他 | 該当項目: なし |
メーカー希望小売価格(税別) | お問い合わせ下さい |
注意事項