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製品の特長

特長

低価格・高品質なシーケンシング

Wet/Dry双方に精通した研究員による事前の技術相談

カスタムメイドでの応用的なバイオインフォマティクス解析もご相談可能

サービス内容

【概要】

全ゲノム領域を対象として次世代シーケンサーによるDNAメチル化 レベルの解析を行う手法です。Bisulfite試薬を用いてDNAを処理後、リファレンスゲノム配列から予想された仮想 Bisulfite処理DNA配列と、次世代シーケンサーで解読された配列を比較することで、個々のシトシン塩基のメチル化状態を解析します。

・DNAメチル化の網羅的解析に

・RNA-seqとの統合解析に

【ご依頼方法】

サンプル数、生物種の情報とともにお問い合わせください。

【DNAメチル化解析の意義】

DNAのメチル化は対象配列のDNA結合因子との親和性を変化させるため、DNAの配列変異と同様に、遺伝子活性の変化を引き起こし得ます。このことから、通常の配列解析では見えない遺伝子活動の変化を明らかにする目的で実施されます。 

また、DNAのメチル化が様々な疾患や健康状態に相関するエピジェネティック・バイオマーカーとして機能することが報告されています。

【データ解析】※ご要望のお客様のみ

お客様の研究目的、ご要望に応じて解析内容をデザイン可能です。

・データQC

 -クオリティスコア

 -重複リードの頻度

 -重複リードの分布

・リードクリーニング

・マッピング

・リードカウント

・相関分析

・メチル化率の算出

・主成分分析

・階層的クラスタリング

・ヒートマップ描画

・群間比較解析

 -可変メチル化シトシン(DMC)の計算

 -可変メチル化領域(DMR)の計算

 -DMC,DMR近傍遺伝子リストの検出

 -近傍遺伝子のGO解析

 -IPAパスウェイ解析

仕様

サンプル種類ゲノムDNA,fastqデータ
解析法Whole Genome Bisulfite Seqencing
報告内容fastqデータ,解析データ,作業完了報告書,Figureなど
目安納期データ取得:サンプル受領より5週~|データ解析:お問い合わせ
その他多検体でさらにディスカウントいたします。ご希望のデータ量により料金は異なります。:
メーカー希望小売価格(税別)お問い合わせ下さい
表示価格は代表的な仕様のものです。詳細はお問い合わせください。
メーカーRhelixa
販売元
メーカーサイト製品ページ
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バイオインフォマティクス解析も強力にサポートします。

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