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製品の特長
特長
低価格・高品質なデータ取得
Wet/Dry双方に精通した研究員による事前の技術相談
カスタムメイドでの応用的なバイオインフォマティクス解析もご相談可能
サービス内容
【概要】
ヒト検体におけるDNAメチル化解析には、イルミナ社の提供するInfinium® MethylationEPICアレイがコストパフォーマンスに優れます。アレイをベースにした解析でありながら、重要なメチル化領域をほぼ全てカバーしているのが特徴です。解析は1塩基レベルではなく領域レベルとなりますが、エピジェネティックな意義を評価する目的には十分であるため、トップジャーナル掲載の論文を含む多くの研究で採用されています。
・85万箇所のメチル化サイトの包括的な解析に
・RNA-seqとの統合解析に
【ご依頼方法】
サンプル数、生物種の情報とともにお問い合わせください。
【DNAメチル化解析の意義】
DNAのメチル化は対象配列のDNA結合因子との親和性を変化させるため、DNAの配列変異と同様に、遺伝子活性の変化を引き起こし得ます。このことから、通常の配列解析では見えない遺伝子活動の変化を明らかにする目的で実施されます。
また、DNAのメチル化が様々な疾患や健康状態に相関するエピジェネティック・バイオマーカーとして機能することが報告されています。
【データ解析】※ご要望のお客様のみ
お客様の研究目的、ご要望に応じて解析内容をデザイン可能です。
・β値の算出
・検出p値の算出
・正規化
・バッチエフェクト補正
・QC:MDS分析
・QC:density plot解析
・QC:階層的クラスタリング
・群間比較解析
－DNAメチル化可変プローブ(DMP)の計算
－DNAメチル化可変領域(DMR)の計算
－DMP,DMR近傍遺伝子リストの抽出
－近傍遺伝子のGO解析
－IPAパスウェイ解析
仕様
| サンプル種類 | ゲノムDNA，raw data |
|---|---|
| 解析法 | Infinium® MethylationEPIC |
| 報告内容 | fastqデータ，解析データ，作業完了報告書，Figureなど |
| 目安納期 | データ取得：サンプル受領より4週～｜データ解析：お問い合わせ |
| その他 | 多検体でさらにディスカウントいたします。ご希望のデータ量により料金は異なります。: |
| メーカー希望小売価格(税別) | 75,000円〜 |
表示価格は代表的な仕様のものです。詳細はお問い合わせください。
| メーカー | Rhelixa |
|---|---|
| 販売元 | Rhelixa |
| メーカーサイト | 製品ページ |
| カタログダウンロード |
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バイオインフォマティクス解析も強力にサポートします。
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注意事項
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