Mirexes Genomics services

# 概要
FFPEブロックより切片を作製し、HE染色および解析用Visiumスライドを作製します。腫瘍マーキングも対応可能です。作製したHE染色画像を確認いただき、解析領域を選択いただきます。シーケンスライブラリー調製、NovaSeqシーケンサーにてシーケンスを実施し、Space Rangerを用いて情報解析を実施します。解析結果は10x Genomics社から無償でダウンロード可能な、Visium空間的遺伝子発現解析の結果を可視化するLoupe Browserで閲覧・追加解析いただけます。

※スライド作製等の一部作業は病理会社へ委託します。


# SeqNova™ LS(Large memory Server)
ゲノムサイズの大きな生物種のゲノム解析、自然環境のメタゲノム解析やメタトランスクリプトーム解析などでお困りではないですか？HSSでは次世代シーケンス解析のために大容量メモリを搭載した高機能サーバーを導入し、解析をお手伝いいたします。

次世代シーケンサーは、遺伝子発現解析、SNPなどの変異解析を行う上で非常に有効な解析ツールです。

しかし、ゲノム情報のない生物種のゲノム解析を行う場合、次世代シーケンサーから出力された短いリード配列を用いてゲノム配列の再構築をする必要があります(de novo アセンブル)。

de novo アセンブルはマッピングに比べて計算量が大きく、計算時間が長い上に大量のメモリを必要とします。

それは、de novo アセンブルを行うには全てのリード同士の組み合わせを網羅的に比較する必要があるためです。そのため、アセンブルの計算量は断片数と断片長に依存して増大していくため、ゲノムサイズの大きな生物種や多種生物ゲノムが混じった環境サンプルなどでは凄まじい計算量を要することになります。

弊社ではヒトサイズゲノム生物のde novo アセンブルを行うことが可能な国内最大級の解析サーバーをご用意して皆様のご利用をお待ちしております。


# 概要
透過型電子顕微鏡（TEM）、走査型電子顕微鏡（SEM）、および試料作製関連の周辺装置を備え、数々の解析経験に基づき金属・高分子材料からラットやマウス等の生体組織・植物・食品中の含水物まで、あらゆる試料の観察・解析を「スピーディー・ローコスト・ハイクオリティー」に行います。電子顕微鏡解析における、試料の前処理とその観察・解析には熟練を要しますが、本サービスは試料作製から試料観察・解析までのどの段階からでも承りますので、無駄な手間や時間を削減することができます。


受託カタログ

画像処理・解析サービス一覧

SeqNova™ データ解析サービス

電子顕微鏡解析

画像処理・解析サービス一覧

Mirxes バイオインフォマティクスサービス 2次解析 空間トランスクリプトーム解析 Stereo-Seq 1000M

Mirxes バイオインフォマティクスサービス 3次解析 空間トランスクリプトーム解析 Stereo-Seq

空間トランスクリプトーム解析（Spatial Transcriptomics）

SeqNova™ データ解析サービス

電子顕微鏡解析

Mirxes バイオインフォマティクスサービス　2次解析　空間トランスクリプトーム解析 Stereo-Seq 1000M

Mirxes バイオインフォマティクスサービス　3次解析　空間トランスクリプトーム解析 Stereo-Seq