
対応可能のプラットフォーム：

DNBSEQ-T7、DNBSEQ-G400、NovaSeq、HiSeq X Ten


# 保有機種
Miseqシリーズから、上位機種であるHiseq Xシリーズ、最新機種のNovaSeq6000を保有。また、Pacific Biosciences社のPacBio Sequel Systemを所有しております。

PacBioシーケンス

特長

・従来のシーケンサーと比較し、圧倒的に長いリード (最大60kbp)が取得可能

・ライブラリー作製時にPCRを行わないため、GCバイアスの影響がない

・超ロングロード解析により、リピート領域全体を決定することが可能


# 概要
全ゲノムシーケンス解析では、コーディング領域と非コーディング領域の両方を含む、ゲノムの包括的な特性評価を行います。がんの進行を促す変異の特定や、疾患との遺伝的関連の研究など、幅広いアプリケーションに利用できます。


# 概要
がん細胞や免疫細胞などの不均一な細胞集団の解析に重要であることから、シングルセル/核解析はいまや遺伝子解析技術の中でもスタンダードの一つになりつつあります。しかしながら、従来の手法では感度的に検出できない遺伝子がある、一度に処理可能な細胞数が限られるなどの制限があり、検体によっては正しい結果が得られないケースがありました。

　そこでイムノジェネテクス社では、日本ベクトン･ディッキンソン (BD) 社のRhapsodyシステムと東京理科大学発の高感度cDNA増幅法 (TAS-Seq法*1) をベースとし、さらに高感度に検出が可能なTAS-seq2法*2を組み合わせたシングルセル/核RNA-seq解析サービスを実施しております。また、お客様のご希望に応じて、現地にてRhapsodyによるシングルセル化、凍結細胞、凍結組織からの調製なども対応可能です。

既存のシングルセル/核RNA-seq解析では対応できない検体や、より正確な評価にぜひお役立てください。



*1：固相担体を用いた核酸増幅方法（PCT/JP2020/027123） *2：相補DNA鎖を増幅する方法（特願2023-036275）


# 解析概要
次世代シーケンサー（NGS）を用いて、ヒトゲノムの塩基配列を決定します。全ゲノム領域を対象として変異検出を行うことで、より包括的にゲノム配列の違いや変化を捉えることができます。遺伝性疾患やがんの原因遺伝子の探索などを目的とした研究にご利用いただけます。

＊ ヒト以外のWhole Genome Sequencingサービスをご希望の場合は別途ご相談ください。

オプションバイオインフォマティクス解析

・トランスジーン挿入位置の探索

　　トランスジーンの挿入位置を網羅的に解析します。

　　遺伝子導入に使用されたベクターおよびインサート配列が必要です。

・ウイルス挿入位置の探索

　　ウイルスゲノムの挿入位置を網羅的に解析します。

　　ゲノム配列が既知のウイルスのみを対象とします。

・染色体組換ブレイクポイントの同定

　　転座などにおける染色体組換ブレイクポイントを同定します。

　　組換えが起こっている染色体のペアまたは片方の染色体位置情報がFISHなどで事前に確認済みであることが必要です。

・Matched-Pair解析

　　がん部と非がん部などの2検体間の比較により違いの見られる箇所を変異として検出します。

　　体細胞変異解析などにご利用いただけます。

解析結果

リード配列を参照配列に対してマッピング※1し、変異箇所(SNV※1)を検出します。 検出されたSNVは、各種アノテーション※2をつけてエクセル・マクロファイルとテキストファイル※3でご提出します。 SNVの検出だけでなく、構造変異の検出結果も納品いたします。


# Mimix™カスタム製品のポイント
＊ 臨床サンプルに類似：ゲノムの複雑性を保持した100%ヒト細胞株由来製品

＊ アレル頻度 = 0.1%を実現可能

＊ 信頼性：ISO9001、ISO13485を取得済


3 min紹介ビデオ（英語）

# 製品概要
Revioシステムは従来のSequel Iieに比べて時間毎のデータ量が15倍にも及ぶ高スペックマシンです。RevioによるSMRTシーケンスは、正確性高く均一なカバレッジで超ロングリードが可能です。取得データはリシーケンス、De novo解析、Iso-Seqに適当します。ご希望の解析内容に沿って、解析プランの提出は可能です。

ご興味ご質問がございましたら、お気軽にお問い合わせください。


受託カタログ

Whole Genomeサービス一覧

調整済みライブラリのシーケンシング

AnnoRoad社の次世代シーケンス受託サービス

全ゲノムシーケンス解析

高感度シングルセル/シングル核RNA-seq解析サービス

Human Whole Genome Sequencing

Mimix™ 標準サンプルカスタム作製サービス

PacBio Revio Cellシーケンス