# サービスの概要
本サービスは、2つ以上の生体サンプル中のタンパク質の相対量を測定する方法ですが、他の定量方法とは異なり、タンパク質の化学結合とラベリングに安定同位体を使用しません。iTRAQ や TMT、あるいは SILAC解析では困難な多数サンプルの相対定量を行う場合に有用な方法です。ラベルフリーの定量的プロテオミクスアプローチは、複雑な生体サンプルから数千のタンパク質の同定・定量する強力なツールです。

ラベルフリーによる解析方法は、プロテオーム解析では最もシンプルかつ低コスト、かつ短時間で解析を行うことができるため、タンパク質の解析で最も主流の分析方法の1つとなっています。



対応可能のプラットフォーム：

DNBSEQ-T7、DNBSEQ-G400、NovaSeq、HiSeq X Ten


# サービス概要
LC-MS/MS分析では、タンパク質をプロテアーゼ処理して得られた断片ペプチドを逆相HPLCで分離・濃縮しながらハイブリッド型質量分析計で検出します。質量分析計により得られたペプチの質量、および質量分析計内でアルゴンガスと衝突させることにより得られたフラグメントイオンのスペクトル（MS/MSデータ）をデータベース検索（Mascot サーチ）することによりタンパク質を同定します。

HPLCで分離しながら分析を行うので、多くのペプチドの情報が得られ、一度の分析で複数のタンパク質が同定できます（ただし、混在する全てのタンパク質、マイナー成分まで同定できるとは限りません）。

ペプチドごとにMS/MSスペクトルが得られるため、１つのペプチドが得られれば、目的タンパク質を同定できます。

「独自のノウハウにより、業界トップの微量分析技術を保有しています（25 fmol から分析可能）。 また高い同定率（95%以上）を誇ります。」

MS/MSデータによるデータベース検索を行うため、アミノ酸配列まで含めた信頼性の高いデータの取得が可能です。


# サービス概要
SILAC （Stable Isotope Labeling using Amino Acids in Cell Culture) 試薬を用いたタンパク質発現・相対定量解析は、安定同位体でラベルしたアミノ酸を含む培養液で培養したサンプルを分析することで、培養細胞由来のタンパク質について同定と発現量の比較定量を同時に行うことができます。


# サービス概要
生体内で生成されたタンパク質は、リン酸化修飾を受け、その機能や局在が調整されていると考えられています。そのためタンパク質の機能を解明する上で、リン酸化修飾の解析は不可欠です。

しかし、リン酸化ペプチドはイオン化されにくい上に存在量も微量であるため、通常の LC-MS/MS 解析では十分なリン酸化ペプチドの情報を得ることは容易ではありません。

本分析では、リン酸化ペプチドを濃縮・精製し、LC-MS/MS 分析に供することで、一度の分析で数百～数千のリン酸化ペプチドを同定することできます。


# サービス概要
組織・細胞や培養上清などから LC-MS/MS（DIA法）を用いて 網羅的にタンパク質を同定し、検体間比較が可能な定量データを取得します。

一度の解析で、～8,000 程度のタンパク質を同定できます（一般的な細胞・組織の場合の目安です）。

DIA (Data independent acquisition) 法では、MSのデータに依存せずに、規定した範囲の全てのMS/MSスペクトルを取得し、事前に構築されたスペクトルライブラリーと照合することで、より高感度で定量性の高いプロテオーム解析を実現しています。

なお、解析に必要なスペクトルライブラリーが構築できない場合などには、従来のDDA (Data dependent acquisition) 法を用いたLC-MS/MSによるショットガン解析を実施しております。


# 高スループットのプロテオーム分析システム
メディカル・プロテオスコープでは、スループットの高いプロテオーム分析システムの確立を目指して試料前処理工程の自動化を進めており、多検体分析のご要望にお応えしています。


受託カタログ

ショットガン解析サービス一覧

ラベルフリー定量プロテオーム解析サービス

調整済みライブラリのシーケンシング

LC-MS/MSによるタンパク質同定

SILAC試薬を用いた比較定量解析

リン酸化DIAプロテオーム解析

DIAプロテオーム解析

多検体プロテオミクス