# 概要
次世代シーケンサー（NGS）を使用した変異解析や発現解析などの各種受託解析を承っております。解析用途に合わせたライブラリー作製の工程のみの受託、あるいは作製されたライブラリーをお預かりしてシーケンスのみの受託も対応しております。

NGSを用いた解析を日々行っている皆様から、これからNGSの利用を考えている皆様まで、幅広くご利用いただけるサービスをご用意いたしました。なお、本サービスは、NGSを用いたゲノム解析で数多くの成果を上げているかずさDNA研究所の協力のもとで提供しております。

● 使用機器

NextSeq 2000, NextSeq 500, MiSeq［イルミナ社］

PacBio Sequel, PacBio Sequel II [PacBio社]

● １細胞NGS 解析（RNA-seq、TCR、BCR） も承っております。詳細はお問い合せください。


# サービス概要
シトシン5位でのDNAのメチル化（5-mC）は安定的なエピジェネティック修飾であり、遺伝子サイレンシング、転移因子の抑制、ゲノムインプリンティング及びX染色体不活性化など、多くの生物学的プロセスに重要な役割を果たしています。遺伝子発現及びエピジェネティックな制御を受けるその他のプロセスを理解するためには、メチル化の検出と定量化が極めて重要です。

全ゲノムバイサルファイトシークエンシング（WGBS）はDNAを亜硫酸水素（バイサルファイト）ナトリウムで処理した後にシーケンシングを行い、メチル化シトシンの検出に使われています。WGBSは、一塩基解像度で解析する全ゲノムメチル化研究のゴールドスタンダードとなっています。


# サービス概要
DNAメチル化は、DNA配列の変化を伴わずに、様々な生命現象の遺伝子発現や表現型に関わる制御機構です。

　DNAメチル化は、CpGアイランドと呼ばれるシトシンの次にグアニンが現れるタイプの2塩基配列の部分などにメチル基が付加される化学反応であり、エピジェネティクスに深く関与しています。



　このDNAのメチル化解析を、バイサルファイトシーケンスにより実施しています。

　ゲノムDNAに対してバイサルファイト処理を行うと、メチル化シトシンは変換されず、非メチル化シトシンがウラシルに変換されます（シーケンス反応ではウラシルはチミンとして検出されます）。このようにメチル化シトシンが変換されないことを利用し、処理前後のシトシン／ウラシル（チミン）の配列差を見分けることで、塩基レベルでメチル化の有無や部位を精度良くゲノムワイドに解析します。



　また、各塩基におけるメチル化の有無の比率をリード数から算出することで、メチル化修飾率を定量的に解析することも可能です。


# 製品概要
全ゲノムバイサルファイトシーケンス（WGBS）は、次世代シーケンス（NGS）とゲノムワイド解析の能力を活用し、一塩基単位の解像度でゲノム網羅的にメチル化パターンの包括的な見解を提供します。

ご提供のgDNAサンプルから、メチル化ライブラリを作成し、NovaSeq/PE150のシーケンス方法で解析を行います。

以下は標準解析の解析内容です。

マッピング、メチル化レベルの算出、DMS/DMR/DMPの検出、機能エンリッチメント解析等。

解析内容の詳細やデモレポートのご依頼など、お気軽にご相談ください。


受託カタログ

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