# サービス説明
GeneChipは光リソグラフィ法による製造で高密度マイクロアレイを実現しています。DNAマイクロアレイのデファクトスタンダードとして世界中の研究者に認知されており、コスト面やデータハンドリング面においても網羅的遺伝子発現解析における有力な解析ツールです。

解析結果はクラボウ独自のソフトウェア「Transcriptome Viewer」でご報告します。マイクロアレイデータの取り扱いが初めてという方にも、クラスタリングなどのグラフ作成、統計解析による発現変動遺伝子の抽出を簡便に行うことができます。

また、遺伝子発現解析用GeneChipは多彩なラインナップで構成されています。長年多くの研究者に利用されてきた「3’IVT Array」、Non-coding RNAの解析も可能な「Gene ST Array」、安価で最新の遺伝子情報が反映された「Clariom S Array」、エクソン単位・ジャンクション部位の発現解析可能でアウトプットデータ数が最大の「Clariom D Array」です。それぞれのアレイには特長がありますので、お客様のニーズに応じたラインナップを選択いただくことができます。


# サービス説明
GeneChipは光リソグラフィ法による製造で高密度マイクロアレイを実現しています。DNAマイクロアレイのデファクトスタンダードとして世界中の研究者に認知されており、コスト面やデータハンドリング面においても網羅的遺伝子発現解析における有力な解析ツールです。

解析結果はクラボウ独自のソフトウェア「Transcriptome Viewer」でご報告します。マイクロアレイデータの取り扱いが初めてという方にも、クラスタリングなどのグラフ作成、統計解析による発現変動遺伝子の抽出を簡便に行うことができます。

miRNA解析用アレイ（miRNA 4.0 Array）はmirBase release 20に基づいてプローブデザインが設計されており、全203生物種のmiRNAを検出することができます。ヒト・マウス・ラットにおいてはmiRNA前駆体のヘアピン配列が、ヒトにおいてはsnoRNA、scaRNAの検出が可能です。


# サービス説明
アジレント社のマイクロアレイは1枚のスライドに複数のサンプルを処理できるプラットフォームになっています。

搭載遺伝子数の違いによって、1枚のスライドで処理できるサンプル数が異なります（8x60K、4x44K、8x15K）。

解析結果はクラボウ独自のソフトウェア「Transcriptome Viewer」でご報告します。マイクロアレイデータの取り扱いが初めてという方にも、クラスタリングなどのグラフ作成、統計解析による発現変動遺伝子の抽出を簡便に行うことができます。


# サービス説明
ゲノムDNAにエクソン領域配列と相同性のあるキャプチャープローブをハイブリダーゼーションさせ、解析対象領域となるDNA配列を回収し、シーケンス解析へ進めます。ヒトの場合、利用するキャプチャープローブによって推奨するシーケンス量が異なります。データ解析においては、既知のゲノム配列（リファレンス配列）にマッピングし、それぞれの染色体位置において変異が起こっている確率を算出します。


# サービス説明
Total RNAからpolyA RNAを精製、逆転写反応で合成したcDNAをシーケンシングします。

ヒト・マウス・ラットなど哺乳動物を対象にした遺伝子発現解析の場合、シーケンス方法は100bpペアエンドシーケンス、取得リード数は40million readでの解析を推奨しています。

データ解析においては、既知のゲノム配列にマッピングし、遺伝子領域内にマッピングされたリード数をカウントし、遺伝子領域長で補正されたデータ（FPKM値）を遺伝子発現値として算出します。

【遺伝子発現解析】：各遺伝子、転写産物の発現値（FPKM値、オプション）を報告します。解析データは弊社開発の「Transcriptome viewer」にてご覧いただくことができます。Transcriptome Viewerでは統計解析によるサンプル間の遺伝子発現比較、発現変動遺伝子の抽出（フィルタリング）、データのグラフ化・可視化（散布図、クラスタリング）などが利用可能で、シーケンス解析後の2次解析をスムーズに進めることができます。

・その他、新規転写産物やスプライシングバリアントの検出も可能です(オプション)


# サービス説明
ゲノムDNAを断片化し、ショットガンシーケンシングを実施します。解析対象となる生物種に応じてデータ取得量を決定します。ヒトの場合では150bpペアエンドシーケンス解析、取得データ量は90Gb（ゲノムカバレッジ約30倍）を推奨しています。

データ解析においては、既知のゲノム配列（リファレンス配列）にマッピングし、それぞれの染色体位置において変異が起こっている確率を算出します。

ヒトの場合は変異解析以外にも、染色体の構造変異、コピー数変異の解析が可能です。


# サービス説明
5解析対象の遺伝子型をTaqMan Probe Assayで判定します。

それぞれの遺伝子型に由来する蛍光強度を指標に、遺伝子型（ホモ・ヘテロ）を判定します。


# サービス説明
リアルタイムPCR法を用いて網羅的に遺伝子発現解析します

キアゲン社、サーモフィッシャーサイエンティフィック社の製品を利用したサービスです

解析対象はパスウェイ関連遺伝子、がん、免疫、神経、薬物動態、バイオマーカーなど、特定のテーマで絞り込んだ遺伝子群です

1回の解析で最大372の遺伝子発現解析が可能です

遺伝子セット総数は250以上、豊富な選択肢を用意しています


# サービス説明
解析対象の遺伝子の発現量をTaqMan Probe Assayで相対定量します。蛍光強度を指標に、解析対象遺伝子の増幅量をリアルタイムにモニタリングします。ある一定の蛍光強度に達した時点の増幅サイクル数（Ct値：Threthold cycle）を計測します。

解析対象遺伝子のCt値は内部標準遺伝子のCt値によって補正され（ΔCt値）、サンプル間の遺伝子発現をそれぞれのΔCt値で比較します（ΔΔCt法）。

TaqMan Probe AssayではPCRの増幅ターゲット領域内に特異的なプローブを設計することで、非特異的増幅によるデータ誤りのリスクを排除できます。

弊社では1検体あたりの増幅反応数を4と設定しております。これにより、安定したデータをご利用いただくことが可能になります。


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遺伝子発現解析(スクリーニングコース)

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