# 概要
全エクソームシーケンス解析では、ゲノム上のタンパク質をコードするエクソン領域（エクソーム）を選択的にキャプチャーし、効率的に解析することができます。疾患を引き起こす多くの変異はヒトゲノムの2%に満たないエクソン領域に位置することが知られており、全エクソームシーケンス解析を行うことで疾患に関わる遺伝子変異の情報を効率的かつ低コストで取得することができます。

【使用試薬】

SureSelect XT Human All Exon V6

SureSelect XT Human All Exon V7

【使用機器】

NovaSeq 6000、NextSeq 500 （Illumina社）

【データ解析】

①体細胞遺伝子変異解析

②薬剤選択情報

　・体細胞遺伝子変異解析

　・ミスマッチ修復遺伝子における遺伝子変異

　・遺伝子変異に対応する分子標的薬の情報

ご指定がない場合は、シーケンス報告書及びシーケンス結果のみご報告いたします。

上記以外も柔軟にご対応させていただきます。詳細はお問い合わせください。


# 概要
ELISPOT解析により、ヒト末梢血単核球（PBMC）中に存在する細胞傷害性T細胞（CTL）から産生されるIFN-γ を単一細胞レベルで検出し、抗原特異的な免疫応答を確認します。ELISPOT解析は、がんや自己免疫疾患、感染症、アレルギーなどの様々な疾患において、抗原特異的免疫応答を研究するために幅広く利用されています。 



◇解析内容

ご提供いただいたヒトPBMCを前培養した後、ELISPOT解析を用いてCTLから産生されるIFN-γ を単一細胞レベルで検出します。前培養なしでの実施や、スポット計数のみのご依頼も承ります。


# 概要
蛍光標識したMHCテトラマーを用いたフローサイトメトリーにより、サンプル中の抗原特異的T細胞を検出します。MHCテトラマー解析は、感染症やがん免疫療法、自己免疫疾患などの基礎研究および臨床開発において、Ｔ細胞免疫応答のモニタリング法として利用されています。ソーティングにより回収した抗原特異的T細胞は、T細胞受容体（T-cell receptor；TCR）レパトア解析用サンプルとして利用することができます。 



◇解析内容

サンプルとして、ヒト末梢血単核球（PBMC）、MHCテトラマー（既製品）もしくは抗原ペプチド（カスタムテトラマー作製用）をご提供いただきます。提供いただいたMHCテトラマー、または弊社にて作製した蛍光標識MHCテトラマーでPBMCを染色し、フローサイトメトリーにより解析を行います。


# 概要
RNAシーケンス解析は、細胞中に存在する既知の遺伝子転写産物（トランスクリプトーム）を網羅的に配列・発現解析し、定量化することができます。従来のマイクロアレイ等の手法に比べて新規の転写産物やスプライシングバリアント、融合遺伝子等を高精度に検出することができます。

【使用試薬】

TruSeq Stranded mRNA

TruSeq Stranded Total RNA

TruSeq RNA Exome

【使用機器】

NovaSeq 6000、NextSeq 500 （Illumina社）

【データ解析】

遺伝子発現解析（RNAシーケンス解析）

RNAシーケンスデータから遺伝子発現量（FPKM）を解析します。

ご指定がない場合は、シーケンス報告書及びシーケンス結果のみご報告いたします。

上記以外も柔軟にご対応させていただきます。詳細はお問い合わせください。


# 概要
T/B細胞は、細胞膜上に発現しているTCR/BCRによって抗原を認識します。あらゆる抗原に反応するために、遺伝子再構成によるTCR/BCRの多様性(レパトア)が生み出されます。「TCR/BCRレパトア解析」によって、生体内での免疫状態変化のモニタリングや、疾患に関連するリンパ球の同定を行うことができます。  



◇解析内容

ヒトおよびマウスの末梢血単核球（PBMC）や組織から抽出されたRNAを用いて、次世代シーケンスにより定量的にTCRやBCRの遺伝子配列を決定し、リンパ球クローンの種類や頻度を解析します。



解析対象

TCR：α鎖、β鎖

BCR：重鎖（IgG、IgM、IgA、IgE）、軽鎖（IgK、IgL）


# 概要
10x GenomicsのChromiumシングルセル遺伝子発現システムを用い、シングルセルの特性解析および遺伝子発現プロファイリングを行います。不均一な細胞集団の特徴を詳細に評価することができます。

（BD RhapsodyTMシングルセル解析システムを用いた解析も可能ですので、ご相談ください。）


# 概要
次世代シーケンスにより、ヒトや土壌、海水由来のDNAサンプルからゲノムを網羅的に解析し、様々な微生物種の同定や機能解析、遺伝子予測、多様性解析を行います。研究目的に合わせて、新規の微生物も対象とする「全メタゲノム解析」と、16S rRNA遺伝子領域にフォーカスする「16S rRNAシーケンス」を選択いただけます。


# 概要
血液等の体液を用いて診断や治療法の選択や治療効果の予測等を行う手法をリキッドバイオプシーといい、従来の組織生検に比べて体に負担をかけることなく、くり返し行うことができる解析として近年注目されています。CPMの「リキッドバイオプシー」では、血液を用いて、がん遺伝子パネル解析を行います。組織生検では採取したがん組織の一部の情報しか得られないのに対し、リキッドバイオプシーでは全身での遺伝子変異をリアルタイムに把握することができます。



TruSight Oncology（TSO）500 ctDNAパネルを用いたリキッドバイオプシーでは、血液検体から523遺伝子を対象にした包括的ゲノムプロファイリングを行うことができます。血漿中のセルフリーDNAを抽出し、次世代シーケンサーNovaSeq6000システムを用いて、１塩基変異（SNV）、挿入・欠失（Indel）、コピー数多型（CNV）および融合遺伝子（Fusion gene）を解析し、腫瘍免疫バイオマーカーとなるマイクロサテライト不安定性（MSI）および腫瘍変異負荷（TMB）の測定を行います。さらに、DRAGEN TSO 500 ctDNA Analysis Softwareにより、データ解析およびレポート作成を迅速に行います。



主要ガイドラインや臨床試験に準じたバイオマーカーを含んでいるため、個々のバイオマーカー解析を複数実施することなく、さまざまながん種に関連する523遺伝子および腫瘍免疫バイオマーカーを包括的に解析することができます。



※TSO500パネルでは、ホルマリン固定パラフィン包埋（FFPE）組織などの腫瘍検体を用いた解析も可能です。



解析の利用例

・がん治療効果のモニタリング

・がん再発の早期検出

・がんの遺伝子変異情報に基づいた薬剤情報の取得　等





バフィーコートを用いた偽陽性確認

血漿や血液を用いたパネル解析では、クローン性造血（CHIP: clonal hematopoiesis of indeterminate potential）に由来する変異も、がん由来の遺伝子変異と同様に検出される場合があります（偽陽性）。バフィーコートを用いて同様にパネル解析を実施することで、検出された変異がクローン性造血に由来する変異である可能性を確認することができます。偽陽性確認をご希望の場合は、同一症例のバフィーコートによる解析を別途ご依頼ください。



【使用試薬】

Oncomine Pan-Cancer Cell-Free Assay（Thermo Fisher Scientific）

TruSight Oncology 500

【使用機器】

次世代シーケンサーIon GeneStudio S5 Prime System（Thermo Fisher Scientific）

NovaSeq 6000（Illumina社）

【データ解析】

取得した塩基配列を用いて、遺伝子変異情報を解析します。


# 概要
全ゲノムシーケンス解析では、コーディング領域と非コーディング領域の両方を含む、ゲノムの包括的な特性評価を行います。がんの進行を促す変異の特定や、疾患との遺伝的関連の研究など、幅広いアプリケーションに利用できます。


受託カタログ

サービス一覧

ELISPOT解析

MHCテトラマー解析

RNAシーケンス解析

TCR/BCRレパトア解析

シングルセルRNAシーケンス解析

メタゲノムシーケンス解析

リキッドバイオプシー

全ゲノムシーケンス解析