# 製品概要
ご提供のgDNAサンプルから、自動化装置を用いてPCRありまたはPCRフリーライブラリを調製し、NovaSeq/PE150のシーケンス方法で解析を行います。

以下は標準解析の解析内容です。

参照ゲノムと照合してマッピングを行い、単塩基置換の変異（SNP）、塩基挿入または欠損による遺伝的変異（Indel）、大きな構造変異（Structure variation: SV）、コピー数変異（Copy Number Variations: CNVs）の候補領域を検出します。同一患者様由来の腫瘍-正常のペアサンプルの場合、ソマチックSNP、Indel、SV、CNVの検出の解析も可能です。

ご質問やデモのご依頼など、お気軽にご相談ください。


# サンガー法によるDNA配列解析
ファスマック社のログインサイトで対象の解析種別をご注文後、対象サンプルとWEBサイトにて発行されるバーコード付きオーダーシートを同梱し、ファスマックへ送付してください。



送付用伝票・発送用BOX等は無償提供しておりますのでご要望がございましたらご連絡ください。

(TEL：046-281-9902、Mail：seqsupport@fasmac.co.jp)


# 概要
ウイルスベクターを用いて製作されたiPS細胞の安全性評価、トランスジェニックマウスのトランスジーン挿入位置同定による品質確認、CHO細胞のトランスジーン挿入位置同定による生産性評価、モバイルエレメントの挿入位置同定による育種研究などに有効です。

●全ゲノムシーケンスを用いた方法

350 bp程度にランダムに断片化したゲノムDNAからライブラリーを調製し、イルミナ社シーケンサーを用いて全ゲノムシーケンスを実施いたします。取得したデータは挿入配列と参照ゲノム配列へマッピングし、両方にマッピングされたリード情報（Discordant reads [d]）およびブレイクポイントをまたぐリード情報（Split reads [s]）から挿入位置を検出、挿入位置の情報を納品いたします。


# 製品概要
ご提供のgDNAサンプルから、自動化装置を用いてPCRありまたはPCRフリーライブラリを調製し、NovaSeq/PE150のシーケンス方法で解析を行います。

以下は標準解析の解析内容です。

ご提供の参照ゲノムと照合してマッピングを行い、単塩基置換の変異（SNP）、塩基挿入または欠損による遺伝的変異（Indel）の候補領域を検出します。

＜オプション＞

大きな構造変異（Structure variation: SV）、コピー数変異（Copy Number Variations: CNVs）の候補領域を検出します。

ご質問やデモのご依頼など、お気軽にご相談ください。


# cfDNAやFFPE DNAライブラリー調製に対応
xGen cfDNA & FFPE DNA Library Prep MC Kit v2は、分解されたサンプルを使用する次のような多くの研究アプリケーションに適した次世代シーケンス（NGS）ライブラリーを生成します。



①SNPの低頻度の体細胞変異の識別

②挿入/削除（インデル）

③遺伝性生殖細胞系列SNPおよびインデルの識別

④全ゲノムシーケンス（WGS）


# 概要
生物ゲノムの多様性に迫る。多様な変異の種類もワンストップで。

変異検出（Resequencing）、遺伝子情報のアノテーションを行います。ヒトサンプルの場合は、各種SNPデータベースの情報も追加します。変異の種類はSNVとshort indel のほか、構造変異（SV）やコピー数多系（CNV）もお任せください。


# Dovetail Genomicsのゲノムアセンブリ
■サンプルを送付するだけの一括サービス

DNA抽出から近接ライゲーションライブラリ作製、

シークエンス、データ解析までを一括して行うことができます。



■あらゆる種類の生物で高い実績

陸上/海洋動物、昆虫、植物など、これまでに1,000件を超えるゲノムアセンブリの実施経験があります。



■フレキシブルな解析オプション

PacBio Sequel II シークエンス、ドラフトアセンブリ作製、

TAD解析、フェージング、ゲノムアノテーション、RNA-seqなど。



■最高品質のデータ納品まで4～5ヶ月

高分子DNA抽出の開始からゲノムアセンブリデータの納品まで。

（別途サンプル輸送期間が必要です）


# 次世代シーケンスデータ解析
公共データベースに眠っているシーケンスデータや、お客様が取得したシーケンスデータについて、1次解析、2次解析まで対応しております。

がん診断の実際にも精通し、統合ゲノム解析についても実績と技術を有し、医学的・臨床的な意義を加えた解釈、解析、解析後の考察まで受託できるのが特徴です。

国内トップ研究機関からも臨床的解析をリピート依頼されております。


# 概要
DNBナノボールシーケンスとPCRフリーなライブラリ調製で高精度な解析を実現

シーケンサー：DNBSEQ-T10×4RS

リードデプス：100x

リード長：150bp

ペア・シングル：ペアエンド

データ量：300Gb

サービス内容：QC、ライブラリ調製、シーケンス、データ出力


Mirexes Genomics services

# サービス概要
超微量バイオマス試料の解析に最適化された独自のプロトコールをご提供いたします。

【プロトコールの概要】

DNA抽出

　お預かりした検体よりDNAを抽出します。DNAの品質に問題がある際はご連絡させて頂く場合がございます。

PCR / ライブラリ調整

　16S rRNA遺伝子領域（V1-V2領域）のPCR増幅、精製、ライブラリ調整を行います。

シーケンス

　次世代シーケンサーを用いて、DNA配列の決定をします。

データ解析

　バイオインフォマティクスツールを用いて種レベルでの菌叢同定とその割合を推定し、解析結果を納品いたします。オプションにて統計解析や論文用のFigの作成も承ります。


受託カタログ

Whole Genomeサービス一覧

ヒト全ゲノムシーケンス - NovaSeq 6000

シーケンスノーマル解析

トランスジーンの挿入位置同定

動植物ゲノムシーケンス - NovaSeq 6000

xGen cfDNA & FFPE DNA Library Preparation Kit

WES遺伝性変異解析

ゲノムアセンブリ受託サービス Dovetail Genomics®

cBioinformatics社のデータ解析サービス

Mirxes フルサービス　ヒト全ゲノムシーケンスーWGS (DNBSEQ-T10×4RS, 100x PE150,300Gb)