# 概要
プロテオーム解析には二次元電気泳動と、質量分析という二つの重要な技術があります。二次元電気泳動法は等電点電気泳動と SDS 電気泳動のニつを組み合わせることにより、細胞内の全タンパク質を数千以上にもおよぶスポットに分離することができます。それぞれのスポット中のタンパク質をトリプシンで分解し、質量分析で解析することでペプチドの質量や部分配列情報が得られます。これらの情報をデータベース検索することでタンパク質の同定や様々な翻訳後修飾の分析が可能です。

Genomine 社は国内外で多数の解析実績を有しており、二次元電気泳動による試料間の比較解析から質量分析計によるタンパク質の同定までプロテオミクス研究を推進する解析一式をご提供致します。


# 分析サービスの概要
タンパク質のリン酸化は重要な翻訳後修飾のひとつであり、とくに可逆的なリン酸化は細胞内シグナル伝達の中心的な役割を担っています。メディカル・プロテオスコープの分析サービスでは、リン酸化ペプチドの選択回収技術と非標識 LC-MS/MS を用いてリン酸化プロテオームを分析します。


# 概要
従来のプロテオーム解析はトランクリプトーム解析と比較すると分析深度が低く、3,000～5,000種類のタンパク質しか観測することができませんでした。これでは様々な分野で着目されることの多いキナーゼや転写因子などの微量タンパク質を観測するには不十分であり、さらなる分析深度の拡大が期待され続けてきました。本サービスの解析を担うかずさDNA研究所では次世代プロテオミクスと称されている分析深度、定量性に優れたDIAプロテオミクス技術を独自に最適化し、さらに最新鋭の質量分析計で測定することにより、哺乳類培養細胞から最大10,000種類のタンパク質を同定・比較定量を行えるシステムを構築しました（観測できるタンパク数はサンプルの種類に依存）。当受託ではこの最新鋭のシステムを用いた世界最高峰のプロテオーム解析を提供いたします。

● 使用機器

Orbitrap Exploris 480 （Thermo Fisher Scientific社）

Q-Exactive HF-X （Thermo Fisher Scientific社）


# サービス概要
MSベースのラベルフリータンパク質定量において、従来のデータ依存性取得（DDA）は、MS1内の特定数のペプチド分子（シグナル強度が最も上位である10個のイオンなど）しか検出できません。これに比べ、DIAはデータに依存しない取得方法であり、質量電荷比ウィンドウの範囲を長時間、連続的に設定することができるため、ウィンドウを通過するすべてのペプチドイオンが断片化され、MS2で確実に検出されるようになります。その結果、DIA法によって、同定されるペプチド数が増加し、精度、安定性や再現性も向上します。これは、ディスカバリープロテオミクスや表現型の比較に最適であると考えられます。


# サービス概要
iTRAQ（Isobaric Tag for Relative and Absolute Quantitation）はAB SCIEX社が開発されました。

タンパク質定量iTRAQテクノロジーでは、複数の同位体試薬を用いて、タンパク質ペプチドのN末端またはリジン側鎖アミノ基を標識します。高精度質量分析により、最大8サンプル間でのプロテオーム発現の差を同時に比較できます。近年、定量的プロテオミクスで広く使われているハイスループットスクリーニング技術です。


# サービス概要
タンパク質リン酸化はタンパク質の翻訳後修飾の最も一般的でかつ重要な方法であり、タンパク質のセリン、スレオニンおよびチロシンで生じます。プロテインキナーゼとホスファターゼにより制御されています。タンパク質のリン酸化と脱リン酸化は細胞増殖、発生、分化、シグナル伝達などの生命活動のプロセス全体を制御しています。そのため、タンパク質リン酸化の研究はタンパク質機能を明確にするうえで非常に重要です。

タンパク質リン酸化解析には主にリン酸化タンパク質の特定と定量が含まれています。


# サービス概要
MALDI-TOF MSを用いて、タンパク質・ペプチドの精密な質量を測定します。

数残基のペプチドから、100 kDa 以下のタンパク質までの精密な質量を測定することができます。


受託カタログ

翻訳後修飾の分析サービス一覧

質量分析受託サービス　MALDI-TOF Mass Spec for Modification Analysis

リン酸化プロテオミクス

DIAプロテオーム解析受託サービス　リン酸化タンパク質の同定と相対定量解析

DIA定量プロテオミクス解析

iTRAQ定量的プロテオミクス解析

リン酸化プロテオミクス解析

MALDI-TOF MSによる精密質量測定